More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0292 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0292  signal peptidase I  100 
 
 		 432 aa  840    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0303  signal peptidase I  31.45 
 
 		 494 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000045382  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  26.86 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  25.88 
 
 		 306 aa  92.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0652  signal peptidase I  25.97 
 
 		 295 aa  87  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0326  signal peptidase I  27.94 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  26.42 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  26.39 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  26.47 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0031  signal peptidase I  27.24 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  29.33 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  27.08 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  26.33 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  26.97 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  26.91 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  25.36 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  40.66 
 
 		 184 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  26.59 
 
 		 268 aa  75.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  29.61 
 
 		 188 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  24.91 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  24.91 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  26.81 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  40.82 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  25.34 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  27.12 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0491  peptidase S26A, signal peptidase I  25.7 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  23.44 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  39.39 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  27.41 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  27.41 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  25.36 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  40.23 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  25 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  26.01 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  43.68 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  24.26 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  43.59 
 
 		 188 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  27.41 
 
 		 305 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  26.26 
 
 		 276 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1785  signal peptidase I  25.44 
 
 		 276 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  25.64 
 
 		 305 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  25.64 
 
 		 305 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  25.64 
 
 		 305 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  25.64 
 
 		 305 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  23.13 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  23.08 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  27.01 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  24.81 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  22.94 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  23.88 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  22.94 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  24.57 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  23.08 
 
 		 321 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  24.73 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  24.73 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  36.89 
 
 		 186 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  26.6 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  41.33 
 
 		 179 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  27.14 
 
 		 305 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  33.66 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  24.19 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  43.06 
 
 		 187 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  24.73 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  32.23 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  33.9 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  22.49 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  31.67 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  33.12 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  22.38 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  23.55 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  25.94 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.38 
 
 		 197 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  31.4 
 
 		 284 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  28.86 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  24.1 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  24.1 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  24.1 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  24.1 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  37.5 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  24.1 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  38.67 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  24.21 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  25.09 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  25.09 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  25.09 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  25.09 
 
 		 324 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  23.88 
 
 		 299 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1799  signal peptidase I  23.81 
 
 		 288 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0193448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  25.09 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  25.09 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  25.09 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  32.35 
 
 		 267 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  26.94 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  25.09 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  36 
 
 		 214 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  22.91 
 
 		 301 aa  66.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  23.21 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  35.64 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  23.21 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  23.55 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>