More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1727 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  93.56 
 
 		 233 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  80.6 
 
 		 234 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  55.76 
 
 		 220 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  54.42 
 
 		 220 aa  231  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  55.3 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  55.3 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  55.3 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  53.95 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  52.51 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  53.02 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  53.54 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  54.93 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  45.09 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0360  signal peptidase I  44.39 
 
 		 217 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  47.51 
 
 		 216 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  50.22 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  50.91 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  50.45 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0009  signal peptidase I  45.93 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.407191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1523  signal peptidase I  42.74 
 
 		 245 aa  175  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  38.81 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  35.19 
 
 		 256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  36.79 
 
 		 274 aa  124  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  34.39 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1803  signal peptidase I  32.73 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  36.02 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  32.44 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  32.44 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34.12 
 
 		 199 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  33.03 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  33.18 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  30.2 
 
 		 305 aa  118  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  35.45 
 
 		 269 aa  118  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  36.02 
 
 		 297 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  36.02 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  35.81 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  35.64 
 
 		 256 aa  115  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  34.52 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  34.98 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  34.5 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  30.88 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  28.86 
 
 		 305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  32.26 
 
 		 299 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  33.93 
 
 		 322 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  33.33 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  33.18 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  30.67 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  33.18 
 
 		 255 aa  111  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  34.5 
 
 		 266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  33.33 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  35.29 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  37.04 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  32.31 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  32.12 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  32.12 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  36.56 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  32.26 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  32.24 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  35.78 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  34.72 
 
 		 305 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  39.36 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  39.36 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  39.36 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  33.33 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  30.59 
 
 		 322 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  39.36 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  39.36 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  39.36 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  31.65 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  33.99 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  33.99 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  39.36 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  35.78 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  30.26 
 
 		 305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  34.31 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  35.29 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  35.29 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  35.29 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  31.39 
 
 		 324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  35.29 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  36.28 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  35.84 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  31.51 
 
 		 305 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  30.84 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  33.78 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  32.3 
 
 		 324 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  30.67 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  30.67 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  32.3 
 
 		 324 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  38.83 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  31.4 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  35.71 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  30.67 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  30.67 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  33.33 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  32.3 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  32.3 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  32.3 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  32.3 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>