More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3710 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  100 
 
 
272 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  38.15 
 
 
187 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  38.15 
 
 
179 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  35.33 
 
 
262 aa  109  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  35.9 
 
 
263 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  29.41 
 
 
267 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  30.67 
 
 
297 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  30.67 
 
 
297 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  30.25 
 
 
297 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  30.25 
 
 
297 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  30.25 
 
 
297 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  30.25 
 
 
297 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  30.25 
 
 
288 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  30.25 
 
 
297 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  35.38 
 
 
267 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1516  signal peptidase I  27.64 
 
 
274 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  39.6 
 
 
171 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  41.5 
 
 
174 aa  99.8  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  31.36 
 
 
270 aa  98.6  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  31.66 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  31.66 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  31.66 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  31.66 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  31.66 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  31.66 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  31.66 
 
 
297 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  32.02 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  31.16 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  36.31 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  31.19 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  31.19 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1525  signal peptidase I  27.04 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  31.68 
 
 
305 aa  96.3  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  32.02 
 
 
305 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  33.85 
 
 
299 aa  95.9  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  29.8 
 
 
297 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  34 
 
 
325 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  32.02 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  29.8 
 
 
297 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  32.43 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  32.16 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  34.87 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  32.16 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  32.74 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  32 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  30.95 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  32.2 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  32 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  32 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  29.65 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  27.92 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  30.33 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  31.71 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  31.71 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  29.31 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  35.29 
 
 
190 aa  92.8  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  32.84 
 
 
300 aa  92.4  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  33 
 
 
325 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  31.28 
 
 
325 aa  92.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  30.88 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  31.19 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  29.52 
 
 
321 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  31.68 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  30.35 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  31.55 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  31.14 
 
 
288 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  31.55 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  35.88 
 
 
184 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  31.44 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  30.54 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  29.06 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  30.54 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  32.18 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  33.85 
 
 
298 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  30.54 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  30.54 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  35.43 
 
 
192 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  35.43 
 
 
193 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  29.07 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  30.3 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  33.16 
 
 
190 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  29.07 
 
 
284 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  31.68 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  31.51 
 
 
322 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  27.83 
 
 
251 aa  89  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  29.07 
 
 
284 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  25.98 
 
 
305 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  27.39 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  27.75 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  32.34 
 
 
176 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  29.96 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  30.95 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  30 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  31.77 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  29.96 
 
 
284 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  34.3 
 
 
187 aa  86.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  32.65 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  30.35 
 
 
304 aa  86.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.54 
 
 
199 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  31.55 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>