132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2551 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  78.56 
 
 		 1739 aa  2784    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  39.67 
 
 		 1808 aa  1102    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  32.44 
 
 		 1744 aa  753    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  36.88 
 
 		 1759 aa  880    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  94.53 
 
 		 1737 aa  3316    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  38.93 
 
 		 1803 aa  1080    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  82.8 
 
 		 1737 aa  2858    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  100 
 
 		 1737 aa  3484    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  80.51 
 
 		 1738 aa  2848    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  38.49 
 
 		 1815 aa  1043    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  42.46 
 
 		 1823 aa  1342    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  44.02 
 
 		 1805 aa  1336    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1159  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  34.48 
 
 		 1621 aa  739    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376607  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  43.05 
 
 		 1835 aa  1353    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.01 
 
 		 1833 aa  967    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  39.61 
 
 		 1808 aa  1100    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  39.77 
 
 		 1808 aa  1081    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  79.93 
 
 		 1743 aa  2850    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  43.3 
 
 		 1839 aa  1322    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  44.31 
 
 		 1832 aa  1433    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  51.95 
 
 		 1782 aa  1703    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  49.77 
 
 		 1772 aa  1570    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  49.91 
 
 		 1772 aa  1567    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.29 
 
 		 1682 aa  674    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  49.42 
 
 		 1758 aa  1588    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  49.25 
 
 		 1768 aa  1513    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  49.33 
 
 		 1765 aa  1600    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  42.95 
 
 		 1824 aa  1310    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  49.97 
 
 		 1768 aa  1582    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  85.78 
 
 		 1737 aa  3028    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1900  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.75 
 
 		 1828 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.73 
 
 		 1635 aa  605  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2253  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1569 aa  599  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4845  lipoprotein, putative  30.44 
 
 		 1649 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.8 
 
 		 1632 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.86 
 
 		 1633 aa  569  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.92 
 
 		 1633 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.92 
 
 		 1633 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.86 
 
 		 1663 aa  565  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.57 
 
 		 1664 aa  555  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.87 
 
 		 1641 aa  551  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.58 
 
 		 1653 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1644 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  31.01 
 
 		 1646 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.71 
 
 		 1653 aa  548  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.71 
 
 		 1653 aa  548  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1641 aa  549  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1653 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1653 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  30.79 
 
 		 1644 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.45 
 
 		 1652 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.63 
 
 		 1653 aa  545  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  30.27 
 
 		 1652 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1644 aa  542  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.57 
 
 		 1653 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.41 
 
 		 1653 aa  539  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  27.83 
 
 		 1665 aa  536  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  28.59 
 
 		 1727 aa  534  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.37 
 
 		 1650 aa  535  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.07 
 
 		 1697 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.86 
 
 		 1823 aa  496  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  27.34 
 
 		 1637 aa  492  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.82 
 
 		 1619 aa  413  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1807 aa  383  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.18 
 
 		 1859 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.3 
 
 		 1785 aa  366  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.13 
 
 		 1819 aa  351  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1529  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.89 
 
 		 1895 aa  271  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.753642  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1028  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.64 
 
 		 1824 aa  268  5.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.29 
 
 		 1992 aa  261  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0163  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.82 
 
 		 1864 aa  260  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1501  alpha-2-macroglobulin family N-terminal region domain protein  22.56 
 
 		 1761 aa  259  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.29 
 
 		 1992 aa  260  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.28 
 
 		 1998 aa  256  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1921 aa  253  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1921 aa  252  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.33 
 
 		 1872 aa  252  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2191  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.33 
 
 		 1854 aa  249  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.56 
 
 		 1872 aa  248  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  25.07 
 
 		 1925 aa  248  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1898 aa  248  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.03 
 
 		 1872 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1834 aa  245  5e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  25.93 
 
 		 2002 aa  241  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.5 
 
 		 2000 aa  226  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.33 
 
 		 1897 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  25.5 
 
 		 2000 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.5 
 
 		 2000 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.44 
 
 		 1821 aa  209  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1077  alpha-2-macroglobulin family protein  23.25 
 
 		 1717 aa  185  7e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0094392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.21 
 
 		 1916 aa  185  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1253  alpha-2-macroglobulin family protein  23.11 
 
 		 1707 aa  180  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  21.99 
 
 		 1906 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.73 
 
 		 1971 aa  167  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.12 
 
 		 1971 aa  166  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  24.39 
 
 		 1974 aa  157  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.21 
 
 		 1872 aa  156  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  22.05 
 
 		 1869 aa  144  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.6 
 
 		 2002 aa  142  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.15 
 
 		 2002 aa  138  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>