104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3362 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  98.58 
 
 		 1534 aa  2991    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  44.05 
 
 		 1582 aa  1258    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  53.97 
 
 		 1521 aa  1579    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  44.39 
 
 		 1603 aa  1249    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  53.91 
 
 		 1516 aa  1576    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  54.04 
 
 		 1516 aa  1575    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  98.78 
 
 		 1504 aa  2996    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  98.31 
 
 		 1504 aa  2981    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  98.71 
 
 		 1504 aa  2997    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  98.31 
 
 		 1504 aa  2988    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  44.44 
 
 		 1596 aa  1250    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  44.07 
 
 		 1594 aa  1264    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  100 
 
 		 1478 aa  3031    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  43.98 
 
 		 1594 aa  1256    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  98.58 
 
 		 1534 aa  2991    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  23.36 
 
 		 1559 aa  218  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.67 
 
 		 1737 aa  213  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.55 
 
 		 1704 aa  159  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.66 
 
 		 1821 aa  159  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.07 
 
 		 2195 aa  143  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.5 
 
 		 2002 aa  137  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.25 
 
 		 2191 aa  132  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.94 
 
 		 1872 aa  132  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.2 
 
 		 1352 aa  131  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.8 
 
 		 2002 aa  131  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.31 
 
 		 1534 aa  128  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.95 
 
 		 1534 aa  127  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.05 
 
 		 1628 aa  123  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  22.55 
 
 		 1869 aa  105  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.89 
 
 		 1971 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.3 
 
 		 1971 aa  102  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.13 
 
 		 1916 aa  99.8  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  25.37 
 
 		 1974 aa  97.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1921 aa  88.6  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.63 
 
 		 1953 aa  88.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.69 
 
 		 1785 aa  87  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.88 
 
 		 1994 aa  84.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.71 
 
 		 1927 aa  82.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1921 aa  79.7  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1921 aa  77.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  20.27 
 
 		 1807 aa  77.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.99 
 
 		 2022 aa  77  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.39 
 
 		 2020 aa  76.3  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.41 
 
 		 2006 aa  72.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.58 
 
 		 2013 aa  71.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  25.55 
 
 		 2002 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  25.2 
 
 		 2019 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.76 
 
 		 2125 aa  70.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  24.05 
 
 		 1906 aa  70.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  25.2 
 
 		 2036 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.2 
 
 		 2036 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.2 
 
 		 2022 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.93 
 
 		 2013 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.93 
 
 		 2013 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  23.73 
 
 		 2016 aa  66.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.59 
 
 		 1859 aa  65.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  24.77 
 
 		 1727 aa  65.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.84 
 
 		 1872 aa  64.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.73 
 
 		 2000 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  24.32 
 
 		 2055 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  24.32 
 
 		 2067 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  24.02 
 
 		 2064 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  24.73 
 
 		 2000 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.73 
 
 		 2000 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  24.32 
 
 		 2055 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  24.32 
 
 		 2050 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  24.32 
 
 		 2057 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.73 
 
 		 1307 aa  63.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.84 
 
 		 1872 aa  63.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  24.02 
 
 		 2053 aa  63.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  23.33 
 
 		 1993 aa  62  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.85 
 
 		 2007 aa  61.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.06 
 
 		 1897 aa  61.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1898 aa  60.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.97 
 
 		 1872 aa  60.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.34 
 
 		 1999 aa  59.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  19.79 
 
 		 2057 aa  59.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.78 
 
 		 2025 aa  58.9  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  33.96 
 
 		 2173 aa  58.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  25.65 
 
 		 1411 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0415  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.9 
 
 		 2084 aa  57.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  32.38 
 
 		 2058 aa  56.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.85 
 
 		 1823 aa  56.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  22.12 
 
 		 1925 aa  53.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  26.85 
 
 		 1874 aa  52.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  30.17 
 
 		 2028 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.98 
 
 		 1758 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.5 
 
 		 2012 aa  50.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1979 aa  50.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  23.19 
 
 		 1665 aa  50.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0715  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.11 
 
 		 1708 aa  50.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2204  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1908 aa  47.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.58 
 
 		 1998 aa  47.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.58 
 
 		 1992 aa  47.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.58 
 
 		 1992 aa  47.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.84 
 
 		 2019 aa  47.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.21 
 
 		 1819 aa  47.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  21.17 
 
 		 1925 aa  47  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0616  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1096 aa  46.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  22.74 
 
 		 1637 aa  46.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>