114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1095 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
1628 aa  3285    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  22.07 
 
 
1559 aa  190  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.49 
 
 
1737 aa  150  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.45 
 
 
2191 aa  139  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.96 
 
 
2195 aa  128  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  22.05 
 
 
1478 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.9 
 
 
1704 aa  110  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  24.03 
 
 
1603 aa  107  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  27.2 
 
 
1516 aa  107  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  27.46 
 
 
1516 aa  107  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.5 
 
 
1821 aa  103  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.42 
 
 
1596 aa  101  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  25.4 
 
 
1582 aa  100  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.83 
 
 
1594 aa  100  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.77 
 
 
1594 aa  98.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.77 
 
 
2002 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  26.05 
 
 
1504 aa  97.1  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  26.05 
 
 
1504 aa  97.1  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  26.07 
 
 
1906 aa  95.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  25.75 
 
 
1534 aa  95.9  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  25.75 
 
 
1504 aa  95.9  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  25.75 
 
 
1534 aa  95.9  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.75 
 
 
1504 aa  95.5  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  25.46 
 
 
1521 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4845  lipoprotein, putative  24.69 
 
 
1649 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.53 
 
 
1758 aa  82.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.42 
 
 
1824 aa  81.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.62 
 
 
2125 aa  81.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  23.77 
 
 
1652 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.21 
 
 
1916 aa  80.5  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.26 
 
 
2002 aa  79  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.08 
 
 
1307 aa  78.6  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.98 
 
 
1768 aa  79  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.64 
 
 
1765 aa  78.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  23.11 
 
 
1744 aa  78.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  25.54 
 
 
1974 aa  78.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.98 
 
 
1633 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.73 
 
 
1664 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.74 
 
 
1633 aa  77  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  23.58 
 
 
1737 aa  75.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.58 
 
 
1632 aa  74.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.51 
 
 
1819 aa  75.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.25 
 
 
1971 aa  75.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.83 
 
 
1835 aa  75.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  24.73 
 
 
1739 aa  74.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.38 
 
 
1619 aa  73.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.53 
 
 
1352 aa  73.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.1 
 
 
1953 aa  72.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.44 
 
 
2057 aa  72.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.73 
 
 
1823 aa  72.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.46 
 
 
1971 aa  72  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.91 
 
 
1663 aa  71.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.39 
 
 
1772 aa  72  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2155  hypothetical protein  24.8 
 
 
1994 aa  69.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.739326  normal  0.0698592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.26 
 
 
1823 aa  69.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  21.79 
 
 
1869 aa  69.3  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.92 
 
 
1872 aa  69.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.07 
 
 
1737 aa  66.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.3 
 
 
1872 aa  66.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.01 
 
 
1772 aa  66.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  20.58 
 
 
1807 aa  65.9  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.66 
 
 
1832 aa  65.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  26.14 
 
 
1727 aa  65.9  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.66 
 
 
1872 aa  65.9  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.66 
 
 
1872 aa  65.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  22.78 
 
 
1737 aa  64.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.29 
 
 
1633 aa  64.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  22.54 
 
 
1839 aa  63.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.67 
 
 
1782 aa  63.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.18 
 
 
1768 aa  63.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.9 
 
 
2019 aa  63.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.36 
 
 
1534 aa  62.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.36 
 
 
1534 aa  62.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.57 
 
 
1808 aa  62.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.16 
 
 
1785 aa  62  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  23.39 
 
 
1738 aa  61.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  23.97 
 
 
1808 aa  60.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.39 
 
 
2173 aa  60.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  26.38 
 
 
1898 aa  59.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  21.58 
 
 
1637 aa  58.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  24.31 
 
 
1737 aa  58.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.04 
 
 
1833 aa  57.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  33.12 
 
 
1815 aa  57  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  22.3 
 
 
1979 aa  56.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.1 
 
 
2025 aa  57.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.42 
 
 
1859 aa  56.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.02 
 
 
1808 aa  56.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1028  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.47 
 
 
1824 aa  56.2  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.71 
 
 
2058 aa  55.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.08 
 
 
1935 aa  55.5  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1159  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.24 
 
 
1621 aa  53.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376607  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.68 
 
 
1697 aa  54.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  23.91 
 
 
2016 aa  52.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  31.76 
 
 
1803 aa  52.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.87 
 
 
1682 aa  52  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2204  hypothetical protein  24.31 
 
 
1908 aa  51.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  23.15 
 
 
1834 aa  51.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  23.61 
 
 
1805 aa  51.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.89 
 
 
1653 aa  50.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  22.45 
 
 
1921 aa  49.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>