79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2155 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0415  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.82 
 
 
2084 aa  837    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336303  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  33.91 
 
 
2028 aa  1053    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  34.75 
 
 
2058 aa  1108    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  36.32 
 
 
2025 aa  1099    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2155  hypothetical protein  100 
 
 
1994 aa  4096    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.739326  normal  0.0698592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  40.27 
 
 
2173 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_002950  PG2204  hypothetical protein  27.68 
 
 
1908 aa  417  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24 
 
 
2019 aa  378  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.93 
 
 
2125 aa  207  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.93 
 
 
1704 aa  137  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.44 
 
 
2057 aa  130  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.04 
 
 
2191 aa  106  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.22 
 
 
1737 aa  105  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.5 
 
 
2002 aa  100  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  21.2 
 
 
1559 aa  89  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.53 
 
 
2002 aa  82.8  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.35 
 
 
1534 aa  70.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.35 
 
 
1534 aa  70.5  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.48 
 
 
1971 aa  70.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.21 
 
 
1971 aa  68.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.38 
 
 
1352 aa  67.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  24.93 
 
 
1974 aa  66.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.74 
 
 
2195 aa  65.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.67 
 
 
1935 aa  64.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.8 
 
 
1628 aa  63.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  25.49 
 
 
1737 aa  63.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  22.4 
 
 
1906 aa  62.4  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.18 
 
 
1737 aa  62  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  20.38 
 
 
1874 aa  62  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.35 
 
 
1594 aa  61.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  24.51 
 
 
1737 aa  61.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  34.83 
 
 
1927 aa  61.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  22.13 
 
 
1869 aa  60.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  25.71 
 
 
1834 aa  59.7  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  26.55 
 
 
1737 aa  58.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  25.07 
 
 
1743 aa  58.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.5 
 
 
1594 aa  58.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  27.87 
 
 
1738 aa  58.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  30.15 
 
 
1582 aa  57.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.78 
 
 
1823 aa  57.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  24.83 
 
 
1739 aa  57  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.94 
 
 
1916 aa  57  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.79 
 
 
1835 aa  55.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.02 
 
 
1821 aa  55.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  24.2 
 
 
1521 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  26.29 
 
 
1921 aa  55.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.39 
 
 
1782 aa  54.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  25.86 
 
 
1921 aa  53.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.66 
 
 
1596 aa  53.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.61 
 
 
1772 aa  52.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.81 
 
 
1824 aa  52.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  28.03 
 
 
1603 aa  51.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.61 
 
 
1768 aa  51.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  24.58 
 
 
1925 aa  51.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.88 
 
 
1307 aa  50.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  29.93 
 
 
1921 aa  50.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.16 
 
 
1953 aa  50.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  26.67 
 
 
1807 aa  50.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.81 
 
 
1682 aa  50.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.99 
 
 
1758 aa  49.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  23.72 
 
 
2036 aa  49.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.72 
 
 
2036 aa  49.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  23.72 
 
 
2019 aa  49.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.72 
 
 
2022 aa  49.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  24.48 
 
 
1839 aa  49.3  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.72 
 
 
2013 aa  48.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.27 
 
 
1663 aa  48.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.28 
 
 
1772 aa  48.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.48 
 
 
1819 aa  48.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  22.83 
 
 
1516 aa  47.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  24.38 
 
 
1925 aa  48.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.32 
 
 
2013 aa  47  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  25.78 
 
 
2016 aa  47  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  27.1 
 
 
2064 aa  47  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1159  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.24 
 
 
1621 aa  47  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376607  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.4 
 
 
1785 aa  46.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  26.61 
 
 
1898 aa  46.6  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  24.73 
 
 
1759 aa  45.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.01 
 
 
2006 aa  45.8  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>