159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1811 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  98.17 
 
 
1534 aa  3061    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  66.97 
 
 
1352 aa  1770    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
1534 aa  3107    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.43 
 
 
1307 aa  445  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.21 
 
 
1704 aa  244  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  26.18 
 
 
1559 aa  224  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.07 
 
 
1737 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.68 
 
 
2191 aa  195  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.86 
 
 
2195 aa  188  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.06 
 
 
1872 aa  186  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.07 
 
 
2002 aa  180  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  23.62 
 
 
1521 aa  157  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  24.13 
 
 
1516 aa  145  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.45 
 
 
2002 aa  144  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  24.4 
 
 
1516 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  22.56 
 
 
1504 aa  135  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  22.56 
 
 
1504 aa  135  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  22.56 
 
 
1504 aa  134  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  22.56 
 
 
1534 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1707  A-macroglobulin like protein  21.68 
 
 
1403 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.780753  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  22.56 
 
 
1534 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.56 
 
 
1504 aa  132  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.48 
 
 
1971 aa  131  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  22.31 
 
 
1478 aa  129  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.26 
 
 
1971 aa  125  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.39 
 
 
1821 aa  125  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  20.93 
 
 
1974 aa  122  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  22.85 
 
 
1582 aa  119  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  21.1 
 
 
1869 aa  119  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.28 
 
 
2125 aa  114  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.18 
 
 
1927 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.24 
 
 
2057 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.27 
 
 
1823 aa  101  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  24.9 
 
 
1925 aa  101  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  20.6 
 
 
1906 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  25.99 
 
 
1807 aa  97.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.71 
 
 
1785 aa  96.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  23.43 
 
 
1921 aa  92.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  23.73 
 
 
1921 aa  92.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  21.92 
 
 
1803 aa  90.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  23.21 
 
 
1603 aa  90.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.49 
 
 
1635 aa  87  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.61 
 
 
1832 aa  86.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  19.48 
 
 
1953 aa  85.5  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.46 
 
 
1916 aa  84.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.77 
 
 
1872 aa  85.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.35 
 
 
1872 aa  84  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.47 
 
 
1872 aa  84  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.87 
 
 
1823 aa  83.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.55 
 
 
1835 aa  83.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.84 
 
 
1664 aa  82.4  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.86 
 
 
1596 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  21.21 
 
 
1898 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.55 
 
 
2000 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.25 
 
 
1594 aa  80.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  25.57 
 
 
1637 aa  79.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  24.76 
 
 
1665 aa  79  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.08 
 
 
1935 aa  79  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.95 
 
 
1594 aa  78.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1077  alpha-2-macroglobulin family protein  22.34 
 
 
1717 aa  78.2  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0094392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.03 
 
 
1650 aa  77  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  21.78 
 
 
1727 aa  76.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1159  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.62 
 
 
1621 aa  76.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376607  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  24.01 
 
 
2002 aa  75.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.78 
 
 
2058 aa  75.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  20.62 
 
 
1839 aa  74.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4845  lipoprotein, putative  23.65 
 
 
1649 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.54 
 
 
1652 aa  74.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  23.93 
 
 
1653 aa  73.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.93 
 
 
1653 aa  73.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  23.58 
 
 
1646 aa  73.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0163  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.98 
 
 
1864 aa  73.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  23.58 
 
 
1644 aa  73.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  23.93 
 
 
1653 aa  73.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.93 
 
 
1653 aa  73.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.23 
 
 
1653 aa  73.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.93 
 
 
1653 aa  73.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  24.58 
 
 
1834 aa  73.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.23 
 
 
1653 aa  73.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.93 
 
 
1653 aa  72.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.67 
 
 
1833 aa  72.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.53 
 
 
1824 aa  72.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  23.58 
 
 
1644 aa  72  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  27.72 
 
 
2028 aa  72  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  23.58 
 
 
1644 aa  72  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2191  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.86 
 
 
1854 aa  72  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466531  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.54 
 
 
1819 aa  72  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.78 
 
 
1633 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.4 
 
 
1633 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  23.05 
 
 
2000 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.05 
 
 
2000 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.17 
 
 
1697 aa  70.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2155  hypothetical protein  26.35 
 
 
1994 aa  70.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.739326  normal  0.0698592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.78 
 
 
1633 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  23.43 
 
 
1411 aa  71.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.4 
 
 
1632 aa  70.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  24.02 
 
 
1652 aa  69.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  22.73 
 
 
1921 aa  67.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0415  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.41 
 
 
2084 aa  68.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336303  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  24.41 
 
 
1815 aa  67.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>