133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3309 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  43.46 
 
 
1921 aa  1488    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  54.88 
 
 
2016 aa  2088    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  69.02 
 
 
2012 aa  2810    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  51.94 
 
 
2019 aa  1998    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  51.91 
 
 
2064 aa  1712    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  54.03 
 
 
1993 aa  2058    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  38.55 
 
 
1925 aa  1130    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  52.5 
 
 
2036 aa  1998    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  98.2 
 
 
2006 aa  3966    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.56 
 
 
2013 aa  2007    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.5 
 
 
2036 aa  1998    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  75.4 
 
 
2007 aa  3006    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  70.46 
 
 
1999 aa  2794    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
2022 aa  4072    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  39.59 
 
 
1910 aa  1196    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  66.18 
 
 
1994 aa  2642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.75 
 
 
2013 aa  1994    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.45 
 
 
2022 aa  1996    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.26 
 
 
2013 aa  2003    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.29 
 
 
2020 aa  2071    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.87 
 
 
1916 aa  254  8.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.08 
 
 
1971 aa  248  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.98 
 
 
1971 aa  244  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.7 
 
 
2191 aa  239  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.22 
 
 
1872 aa  236  5e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  28.53 
 
 
1974 aa  231  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  56.32 
 
 
2067 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  56.32 
 
 
2050 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  56.32 
 
 
2055 aa  224  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  56.32 
 
 
2055 aa  224  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  56.32 
 
 
2057 aa  224  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  55.79 
 
 
2053 aa  223  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.32 
 
 
1821 aa  211  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.53 
 
 
1953 aa  207  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.58 
 
 
2195 aa  203  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.29 
 
 
2002 aa  163  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.89 
 
 
2002 aa  159  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  22.59 
 
 
1559 aa  145  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.88 
 
 
1704 aa  141  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  23.93 
 
 
1906 aa  135  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.88 
 
 
1737 aa  125  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  19.94 
 
 
1823 aa  118  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.77 
 
 
1935 aa  105  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  20.22 
 
 
1921 aa  99.8  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  20.61 
 
 
1921 aa  97.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.92 
 
 
1594 aa  97.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.85 
 
 
1594 aa  95.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.17 
 
 
1927 aa  94  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  22.56 
 
 
1808 aa  91.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.07 
 
 
1808 aa  87  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  21.31 
 
 
1603 aa  85.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  22.1 
 
 
1478 aa  84.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  21.28 
 
 
1925 aa  83.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  22.46 
 
 
1869 aa  82.4  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  22.08 
 
 
1534 aa  82  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.08 
 
 
1504 aa  82  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  22.08 
 
 
1534 aa  82  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  22.52 
 
 
1582 aa  82  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  22.16 
 
 
1637 aa  80.5  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.41 
 
 
1596 aa  80.1  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.27 
 
 
1765 aa  79.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  24.53 
 
 
1504 aa  77  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  24.53 
 
 
1504 aa  77.4  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  24.53 
 
 
1504 aa  77  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  24.04 
 
 
1727 aa  75.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.47 
 
 
1819 aa  75.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.63 
 
 
1785 aa  75.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  18.46 
 
 
1807 aa  74.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.5 
 
 
1758 aa  73.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.46 
 
 
1859 aa  73.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  21.26 
 
 
1653 aa  71.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.19 
 
 
1833 aa  71.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  21.26 
 
 
1653 aa  71.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.26 
 
 
1653 aa  70.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.79 
 
 
1808 aa  70.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.24 
 
 
1652 aa  70.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.26 
 
 
1653 aa  70.1  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  22.69 
 
 
1516 aa  69.3  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.32 
 
 
1653 aa  68.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.32 
 
 
1653 aa  68.9  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.85 
 
 
1832 aa  68.6  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.17 
 
 
1653 aa  68.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.21 
 
 
1653 aa  67.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.98 
 
 
1872 aa  67.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1159  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.34 
 
 
1621 aa  67.4  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376607  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  22.81 
 
 
1516 aa  67.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.81 
 
 
1872 aa  66.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  24.48 
 
 
1759 aa  65.9  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.52 
 
 
1697 aa  66.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.19 
 
 
1872 aa  65.9  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  21.41 
 
 
1898 aa  64.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  20.76 
 
 
1644 aa  64.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  20.76 
 
 
1644 aa  63.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  20.76 
 
 
1644 aa  63.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23 
 
 
1632 aa  63.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  20.87 
 
 
1646 aa  62.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.52 
 
 
1633 aa  61.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  22.65 
 
 
1815 aa  61.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.97 
 
 
1633 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.52 
 
 
1633 aa  60.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>