138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3980 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  42.25 
 
 
1921 aa  1434    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  81.69 
 
 
2055 aa  2929    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  53.91 
 
 
2016 aa  2093    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  81.63 
 
 
2067 aa  2929    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  92.72 
 
 
2019 aa  3789    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  80.45 
 
 
2064 aa  3249    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  53.67 
 
 
1993 aa  2043    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  37.56 
 
 
1925 aa  1130    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  93.08 
 
 
2036 aa  3744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
2013 aa  4089    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  93.08 
 
 
2036 aa  3744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  54.15 
 
 
2007 aa  2049    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.6 
 
 
1999 aa  2026    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.31 
 
 
2022 aa  1983    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  81.74 
 
 
2055 aa  2931    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  81.52 
 
 
2053 aa  2932    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  81.63 
 
 
2050 aa  2944    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  81.65 
 
 
2057 aa  2927    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  52.85 
 
 
2012 aa  2059    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.23 
 
 
1910 aa  1127    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  51.09 
 
 
1994 aa  1932    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  90.27 
 
 
2013 aa  3624    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  93.13 
 
 
2022 aa  3746    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  98.46 
 
 
2013 aa  4031    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  52.16 
 
 
2006 aa  1980    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  68.04 
 
 
2020 aa  2783    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.45 
 
 
1872 aa  276  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.74 
 
 
1821 aa  253  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  28 
 
 
1971 aa  234  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.11 
 
 
1971 aa  228  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.66 
 
 
1916 aa  225  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  27.13 
 
 
1974 aa  221  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.1 
 
 
1953 aa  221  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.41 
 
 
2191 aa  216  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.79 
 
 
2002 aa  201  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.71 
 
 
2195 aa  198  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.03 
 
 
2002 aa  177  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  21.94 
 
 
1906 aa  152  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.55 
 
 
1737 aa  139  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.85 
 
 
1704 aa  132  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.27 
 
 
1935 aa  129  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  21.03 
 
 
1869 aa  127  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.57 
 
 
1823 aa  118  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.55 
 
 
1927 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  20.32 
 
 
1559 aa  105  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  20.36 
 
 
1807 aa  99.4  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  24.22 
 
 
1744 aa  96.7  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.51 
 
 
1785 aa  93.2  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  23.75 
 
 
1759 aa  92.4  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.63 
 
 
1859 aa  87.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.75 
 
 
1998 aa  83.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.75 
 
 
1992 aa  83.2  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.24 
 
 
1992 aa  82.8  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.66 
 
 
1832 aa  82  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  21.38 
 
 
1925 aa  80.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.09 
 
 
1833 aa  80.1  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  21.69 
 
 
1898 aa  79  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  21.16 
 
 
1727 aa  77.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.97 
 
 
1650 aa  77  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  20.89 
 
 
1644 aa  75.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.62 
 
 
1835 aa  75.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.91 
 
 
1872 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.68 
 
 
1737 aa  75.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.96 
 
 
1596 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  23.82 
 
 
1743 aa  74.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  19.75 
 
 
1637 aa  73.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.46 
 
 
1633 aa  73.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  20.08 
 
 
1834 aa  73.2  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.33 
 
 
1632 aa  72.8  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  20.71 
 
 
1646 aa  72.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  20.8 
 
 
1644 aa  72.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.36 
 
 
1633 aa  72.4  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  20.8 
 
 
1644 aa  71.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.98 
 
 
1872 aa  72  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.61 
 
 
1758 aa  72  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.85 
 
 
1823 aa  71.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  24.55 
 
 
1534 aa  70.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  24.55 
 
 
1534 aa  70.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.23 
 
 
1633 aa  70.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  24.93 
 
 
1478 aa  70.1  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  24.55 
 
 
1504 aa  70.1  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  24.55 
 
 
1504 aa  70.1  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.55 
 
 
1504 aa  70.1  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  24.55 
 
 
1504 aa  70.1  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.7 
 
 
1653 aa  69.7  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.3 
 
 
1697 aa  69.7  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.8 
 
 
1808 aa  67.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.7 
 
 
1653 aa  67.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.7 
 
 
1653 aa  67.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.35 
 
 
1652 aa  67.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  20.74 
 
 
1653 aa  67.4  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  20.74 
 
 
1653 aa  67.4  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.6 
 
 
1653 aa  67  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.79 
 
 
1594 aa  67  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.95 
 
 
1819 aa  66.6  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  25.86 
 
 
1808 aa  66.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.26 
 
 
1653 aa  66.2  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  20.04 
 
 
1921 aa  65.9  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  25.25 
 
 
1815 aa  65.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.3 
 
 
1594 aa  65.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>