141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4444 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  42.07 
 
 		 1921 aa  1431    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  81.8 
 
 		 2055 aa  2941    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  52.41 
 
 		 2006 aa  1980    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  54.08 
 
 		 2016 aa  2099    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  92.82 
 
 		 2019 aa  3792    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  80.55 
 
 		 2064 aa  3253    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  53.73 
 
 		 1993 aa  2044    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  37.45 
 
 		 1925 aa  1126    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  93.22 
 
 		 2036 aa  3747    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  98.46 
 
 		 2013 aa  4031    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  93.22 
 
 		 2036 aa  3747    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  54.2 
 
 		 2007 aa  2048    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.33 
 
 		 1999 aa  2027    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.31 
 
 		 2022 aa  1982    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  81.85 
 
 		 2055 aa  2942    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  81.74 
 
 		 2050 aa  2950    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  81.76 
 
 		 2057 aa  2936    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  52.9 
 
 		 2012 aa  2059    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.06 
 
 		 1910 aa  1126    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  50.69 
 
 		 1994 aa  1937    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  90.52 
 
 		 2013 aa  3622    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  68.09 
 
 		 2020 aa  2783    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  93.32 
 
 		 2022 aa  3749    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 		 2013 aa  4088    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  87.3 
 
 		 2053 aa  353  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  86.77 
 
 		 2067 aa  350  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.54 
 
 		 1872 aa  275  7e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.31 
 
 		 1821 aa  254  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  28 
 
 		 1971 aa  231  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.95 
 
 		 1916 aa  231  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.11 
 
 		 1971 aa  226  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  26.84 
 
 		 1974 aa  218  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.6 
 
 		 2191 aa  216  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.76 
 
 		 1953 aa  214  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.74 
 
 		 2002 aa  203  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.93 
 
 		 2195 aa  201  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.24 
 
 		 2002 aa  188  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  21.81 
 
 		 1906 aa  149  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.76 
 
 		 1737 aa  142  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.09 
 
 		 1704 aa  132  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.27 
 
 		 1935 aa  131  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  20.91 
 
 		 1869 aa  125  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.37 
 
 		 1823 aa  121  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.53 
 
 		 1927 aa  107  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  20.32 
 
 		 1559 aa  105  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.51 
 
 		 1785 aa  97.1  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1744 aa  93.6  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  24.03 
 
 		 1759 aa  93.6  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.54 
 
 		 1859 aa  88.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.85 
 
 		 1832 aa  86.7  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.02 
 
 		 1992 aa  84  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.02 
 
 		 1992 aa  83.2  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.38 
 
 		 1998 aa  83.2  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  21.76 
 
 		 1925 aa  82.8  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  20.6 
 
 		 1807 aa  82  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.09 
 
 		 1833 aa  80.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.9 
 
 		 1835 aa  78.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1898 aa  77.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  20.99 
 
 		 1727 aa  77  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.75 
 
 		 1650 aa  76.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  21.07 
 
 		 1644 aa  76.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.08 
 
 		 1596 aa  75.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  19.68 
 
 		 1637 aa  75.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.53 
 
 		 1758 aa  75.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.91 
 
 		 1872 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.13 
 
 		 1823 aa  74.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1644 aa  73.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  21.95 
 
 		 1644 aa  73.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1743 aa  73.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.4 
 
 		 1737 aa  73.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.33 
 
 		 1872 aa  73.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  20.96 
 
 		 1646 aa  73.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  20.08 
 
 		 1834 aa  73.2  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.99 
 
 		 1697 aa  70.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  24.55 
 
 		 1534 aa  70.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.36 
 
 		 1653 aa  70.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1534 aa  70.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.55 
 
 		 1504 aa  70.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  24.55 
 
 		 1504 aa  70.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  24.55 
 
 		 1504 aa  70.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  24.55 
 
 		 1504 aa  70.1  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  24.93 
 
 		 1478 aa  70.1  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.4 
 
 		 1633 aa  69.7  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.23 
 
 		 1652 aa  69.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  20.45 
 
 		 1653 aa  68.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.29 
 
 		 1633 aa  69.3  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  20.45 
 
 		 1653 aa  68.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.36 
 
 		 1653 aa  69.3  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.11 
 
 		 1632 aa  69.3  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.36 
 
 		 1653 aa  69.3  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  23.11 
 
 		 1737 aa  67.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.27 
 
 		 1653 aa  67.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.96 
 
 		 1633 aa  67.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  19.93 
 
 		 1653 aa  67  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.95 
 
 		 1819 aa  67.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1808 aa  66.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  20.17 
 
 		 1921 aa  65.9  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.61 
 
 		 1808 aa  65.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.14 
 
 		 1897 aa  65.5  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.62 
 
 		 1594 aa  65.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>