13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0616 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0616  hypothetical protein  100 
 
 
1096 aa  2190    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0393  hypothetical protein  32.1 
 
 
168 aa  89.7  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0978889  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0810  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  77.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3047  hypothetical protein  37.01 
 
 
986 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.845635  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0163  hypothetical protein  40 
 
 
287 aa  52.8  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  30.5 
 
 
605 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  31.43 
 
 
1534 aa  47  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  30.71 
 
 
1504 aa  46.6  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.43 
 
 
1504 aa  47  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  30.71 
 
 
1478 aa  47  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  31.43 
 
 
1534 aa  47  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  30.71 
 
 
1504 aa  46.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  30.71 
 
 
1504 aa  46.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>