107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1933 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1933  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  498  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0367  hypothetical protein  26.94 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6188  hypothetical protein  27.11 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.19766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 979 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0070  hypothetical protein  23.93 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0591  hypothetical protein  26.79 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4195  hypothetical protein  26.03 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.582705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  38.05 
 
 		 1010 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  38.6 
 
 		 1008 aa  60.1  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  37.84 
 
 		 1021 aa  59.7  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1038 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1070 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  30.16 
 
 		 894 aa  53.9  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  37.17 
 
 		 1034 aa  53.1  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 1056 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1064 aa  51.6  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  35.51 
 
 		 1064 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1057 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  37.74 
 
 		 1139 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 1093 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 922 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  33.04 
 
 		 1047 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1062 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0048  hypothetical protein  30.48 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  35.85 
 
 		 1134 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  33.65 
 
 		 1080 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  32.48 
 
 		 805 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  35.34 
 
 		 1065 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1072 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  32.08 
 
 		 1123 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1071 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 1105 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 1049 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 791 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1037 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  31.4 
 
 		 853 aa  48.9  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1099 aa  48.5  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1102 aa  48.5  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  35.51 
 
 		 1028 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 791 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  34 
 
 		 1025 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1027 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1173 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 987 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  28.7 
 
 		 709 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1071 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 		 1068 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 1038 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 1033 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1163 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1084 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1020 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1047 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  39.73 
 
 		 1008 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1059 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1038 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1062 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1084 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 992 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1064 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 1039 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1023 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  33.33 
 
 		 833 aa  44.7  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2401  hypothetical protein  31.33 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  28.32 
 
 		 1095 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 982 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 		 1096 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1003 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  36.05 
 
 		 1110 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1016 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1107 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1059 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  30.77 
 
 		 1043 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  31.4 
 
 		 1005 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1099 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1051 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10788  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  37.84 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  38.98 
 
 		 1113 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1006 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 1090 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 1185 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1049 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 998 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 1033 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  35.82 
 
 		 1051 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1082 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1101 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  27 
 
 		 1018 aa  42.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1154 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1063 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  25.41 
 
 		 829 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 994 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1114 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 1071 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  36.14 
 
 		 1083 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  34.38 
 
 		 993 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  36.05 
 
 		 1008 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  34.04 
 
 		 854 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1048 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 977 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>