224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1210 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  99.8 
 
 		 711 aa  1002    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1210  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 506 aa  1035    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130069 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 		 735 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 		 735 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 760 aa  86.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 721 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 721 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 792 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 809 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 703 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 807 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 693 aa  67.8  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  26.59 
 
 		 774 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 774 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 777 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.25 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  25.09 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  24.72 
 
 		 774 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 774 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  24.72 
 
 		 774 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  24.72 
 
 		 774 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 774 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 738 aa  64.7  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 738 aa  64.7  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  30.26 
 
 		 809 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 809 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  25.87 
 
 		 809 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 708 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 723 aa  61.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  28.42 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 754 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 754 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  25.41 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  21.96 
 
 		 765 aa  60.1  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 753 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4800  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 848 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 782 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 614 aa  57.4  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 736 aa  57.4  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 728 aa  57.4  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 725 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.58 
 
 		 784 aa  57  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.07 
 
 		 711 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  23.01 
 
 		 710 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2551  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 777 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0190132  normal  0.953315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  29.52 
 
 		 706 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.83 
 
 		 782 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 737 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  25.51 
 
 		 717 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 689 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 722 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 722 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2935  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 801 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 593 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 868 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 722 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 725 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 742 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.33 
 
 		 685 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  28.92 
 
 		 706 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  28.92 
 
 		 721 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  28.92 
 
 		 706 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  28.92 
 
 		 706 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 731 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0955  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 802 aa  53.9  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125718 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  25.98 
 
 		 699 aa  53.9  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 720 aa  53.9  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 736 aa  53.9  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 786 aa  53.5  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  27.92 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.92 
 
 		 821 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 699 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.92 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.92 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.92 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 700 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 700 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 700 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 827 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 700 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 704 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 700 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 705 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 700 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 706 aa  52  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 700 aa  52  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 742 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2714  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 856 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.360758  normal  0.210323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 653 aa  52  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 688 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 700 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  27.5 
 
 		 685 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 722 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 635 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 734 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  21.76 
 
 		 633 aa  51.2  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  23.55 
 
 		 711 aa  50.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>