115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2147 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2147  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 760 aa  1539    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1166  TonB-dependent receptor  41.35 
 
 		 765 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1492  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 711 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 735 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 735 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1210  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 506 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130069 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 729 aa  75.9  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 790 aa  70.9  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 734 aa  65.1  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.14 
 
 		 705 aa  62  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0908  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 778 aa  62  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0763  TonB-dependent receptor, putative  24.68 
 
 		 778 aa  62  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 753 aa  61.6  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3419  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  21.69 
 
 		 784 aa  59.7  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  19.57 
 
 		 760 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 		 720 aa  58.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  23.55 
 
 		 693 aa  58.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 786 aa  57.4  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  20.83 
 
 		 766 aa  56.2  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 		 809 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  24.16 
 
 		 713 aa  54.3  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  20.94 
 
 		 673 aa  53.5  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  23.49 
 
 		 713 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  19.24 
 
 		 760 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 790 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 725 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.67 
 
 		 718 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 738 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 738 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 662 aa  52.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 681 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 796 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 725 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 644 aa  51.6  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 725 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  23.97 
 
 		 774 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 774 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.77 
 
 		 774 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  23.97 
 
 		 774 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  24.54 
 
 		 784 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 774 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  23.97 
 
 		 774 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  25.56 
 
 		 784 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 		 774 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 815 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 833 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 732 aa  50.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 796 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 712 aa  50.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 725 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  22.07 
 
 		 728 aa  49.3  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  23.49 
 
 		 713 aa  48.9  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6547  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 791 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 736 aa  48.9  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 669 aa  48.9  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 697 aa  48.9  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  20.42 
 
 		 792 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 786 aa  48.9  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 758 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  21.08 
 
 		 724 aa  48.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 708 aa  48.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 687 aa  48.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 841 aa  47.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 621 aa  48.1  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 709 aa  47.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 724 aa  47.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.63 
 
 		 706 aa  47.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 758 aa  47.4  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 779 aa  47.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  23.47 
 
 		 620 aa  47  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 758 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 782 aa  47.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.63 
 
 		 706 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.63 
 
 		 706 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.57 
 
 		 721 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 758 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 747 aa  46.6  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  19.83 
 
 		 753 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 698 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 718 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 698 aa  46.2  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 698 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 796 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 793 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.88 
 
 		 766 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 705 aa  45.8  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  21.02 
 
 		 788 aa  45.8  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.29 
 
 		 706 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.04 
 
 		 715 aa  45.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 726 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  20.21 
 
 		 735 aa  45.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  22.68 
 
 		 702 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 758 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  22.68 
 
 		 702 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  26.9 
 
 		 758 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 780 aa  45.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  26.9 
 
 		 758 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  23.4 
 
 		 734 aa  45.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 804 aa  45.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>