More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0299 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  99.45 
 
 		 725 aa  1483    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  99.31 
 
 		 725 aa  1482    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 725 aa  1491    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  73.35 
 
 		 718 aa  1122    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  90.07 
 
 		 723 aa  1375    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  86.76 
 
 		 723 aa  1289    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  86.62 
 
 		 723 aa  1286    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  99.17 
 
 		 725 aa  1481    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  86.07 
 
 		 723 aa  1302    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  88.99 
 
 		 332 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  41.64 
 
 		 700 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  40.92 
 
 		 701 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  39.75 
 
 		 701 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  40.05 
 
 		 721 aa  508  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 		 809 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 704 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  38.39 
 
 		 713 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 		 716 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 728 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 		 849 aa  282  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  30.62 
 
 		 721 aa  275  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 710 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 783 aa  264  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  28.07 
 
 		 717 aa  261  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  29.18 
 
 		 704 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 716 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 738 aa  252  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  28.93 
 
 		 724 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  28.32 
 
 		 713 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  28.28 
 
 		 813 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  28.26 
 
 		 816 aa  234  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 751 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  28.97 
 
 		 714 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 697 aa  224  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 817 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.75 
 
 		 709 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 758 aa  219  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 839 aa  216  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  28.73 
 
 		 771 aa  211  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 843 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  27.26 
 
 		 723 aa  203  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 742 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  28.23 
 
 		 732 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 764 aa  198  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 753 aa  198  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 745 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  28.23 
 
 		 733 aa  197  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 732 aa  194  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 745 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 698 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 739 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 745 aa  190  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 808 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 817 aa  187  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  26.26 
 
 		 812 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 746 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 808 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  25.94 
 
 		 755 aa  184  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 726 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 726 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  25.65 
 
 		 723 aa  177  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 726 aa  176  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 758 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  20.95 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 891 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 698 aa  77  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  23.29 
 
 		 764 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.62 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 736 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 758 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  20.51 
 
 		 676 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  22.18 
 
 		 764 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  33.87 
 
 		 726 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  24.04 
 
 		 660 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  24.04 
 
 		 660 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 758 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  24.81 
 
 		 741 aa  70.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 737 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.16 
 
 		 861 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 		 723 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 750 aa  68.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.56 
 
 		 759 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 742 aa  67.4  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 758 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.61 
 
 		 859 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.77 
 
 		 712 aa  66.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 		 716 aa  66.6  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.13 
 
 		 762 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  29 
 
 		 688 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.83 
 
 		 862 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 709 aa  65.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.33 
 
 		 661 aa  65.1  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 820 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.52 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.97 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.56 
 
 		 862 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  29.35 
 
 		 814 aa  64.7  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3064  TonB-dependent siderophore receptor  33.15 
 
 		 712 aa  65.1  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 821 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 759 aa  64.7  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>