More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1820 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 697 aa  1411    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  39.77 
 
 		 849 aa  458  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  41.14 
 
 		 738 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  34.23 
 
 		 771 aa  354  4e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  33.79 
 
 		 813 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  33.7 
 
 		 816 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 783 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 843 aa  322  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  33.88 
 
 		 812 aa  320  6e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 710 aa  317  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 839 aa  317  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  32.44 
 
 		 721 aa  305  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 700 aa  303  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  29.66 
 
 		 717 aa  303  9e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  32.57 
 
 		 724 aa  300  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 817 aa  294  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  31.59 
 
 		 714 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  30.85 
 
 		 713 aa  290  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 716 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 739 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  30.58 
 
 		 709 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 701 aa  287  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  32.25 
 
 		 704 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 701 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 704 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 758 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 718 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  29.34 
 
 		 713 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  27.89 
 
 		 732 aa  250  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 723 aa  249  9e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 753 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 732 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 721 aa  248  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  28.43 
 
 		 755 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 809 aa  245  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 723 aa  244  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  28.19 
 
 		 733 aa  244  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 746 aa  238  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 725 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  27.32 
 
 		 723 aa  237  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 725 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 725 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 725 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 723 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 751 aa  233  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 723 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 726 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 726 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 726 aa  219  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 716 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 745 aa  206  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 745 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 745 aa  203  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  26.34 
 
 		 723 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 728 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 698 aa  179  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 764 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 742 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 817 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 808 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 808 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  32.52 
 
 		 332 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  34.23 
 
 		 639 aa  103  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  34.26 
 
 		 646 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  41.29 
 
 		 656 aa  87.4  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  30.89 
 
 		 618 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 634 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  43.18 
 
 		 650 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  43.18 
 
 		 650 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  43.18 
 
 		 650 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  43.18 
 
 		 650 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  43.18 
 
 		 650 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  40.91 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  40.91 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  40.91 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  40.91 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  40.91 
 
 		 659 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  40.91 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  40.91 
 
 		 641 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  40.91 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  32.4 
 
 		 626 aa  80.9  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 681 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 634 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  37.75 
 
 		 638 aa  78.6  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 737 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 686 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  38.36 
 
 		 593 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  37.66 
 
 		 677 aa  75.1  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 657 aa  74.7  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 688 aa  74.3  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35.57 
 
 		 631 aa  73.9  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 736 aa  74.3  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 694 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  34.15 
 
 		 647 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.08 
 
 		 614 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  39.16 
 
 		 655 aa  73.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.22 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.69 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.13 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>