More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3064 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2724  FhuE receptor  68.18 
 
 		 707 aa  976    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  65.32 
 
 		 718 aa  972    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3064  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 712 aa  1459    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  71.55 
 
 		 723 aa  1093    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  76.47 
 
 		 726 aa  1135    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  67.56 
 
 		 716 aa  1011    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  42.82 
 
 		 725 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  40.28 
 
 		 720 aa  515  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2798  TonB-dependent receptor  37.33 
 
 		 686 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000816891  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2549  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 		 700 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 		 693 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 733 aa  389  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00133  FhuE receptor  32.58 
 
 		 697 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 		 696 aa  389  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  34.08 
 
 		 693 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3929  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 702 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3277  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 702 aa  385  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  35 
 
 		 814 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 731 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 729 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  34.2 
 
 		 722 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  34.56 
 
 		 799 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 		 753 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  33.58 
 
 		 722 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 		 723 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 722 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  32.96 
 
 		 753 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 		 748 aa  365  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 714 aa  364  4e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  34.3 
 
 		 815 aa  363  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  34.49 
 
 		 802 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1823  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 		 696 aa  358  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.077851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 732 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 827 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0311  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 697 aa  357  5e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000107098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  35.26 
 
 		 816 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 		 730 aa  355  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  32.56 
 
 		 747 aa  355  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 747 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  32.92 
 
 		 723 aa  353  5e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  32.83 
 
 		 741 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 		 747 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 741 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 741 aa  349  9e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 		 735 aa  349  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 840 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 740 aa  344  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  32.06 
 
 		 766 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  31.8 
 
 		 721 aa  343  5.999999999999999e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  31.88 
 
 		 699 aa  340  7e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.77 
 
 		 737 aa  337  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 833 aa  333  9e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  32.33 
 
 		 803 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  32.41 
 
 		 812 aa  331  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.97 
 
 		 724 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 		 737 aa  326  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  33.09 
 
 		 737 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.83 
 
 		 724 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.83 
 
 		 724 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 		 737 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4426  TonB-dependent siderophore receptor  31.57 
 
 		 728 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 728 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 		 723 aa  323  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 		 806 aa  323  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 795 aa  323  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.69 
 
 		 724 aa  323  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  32.52 
 
 		 700 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.57 
 
 		 729 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.69 
 
 		 724 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 728 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  31.57 
 
 		 728 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.42 
 
 		 729 aa  321  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.42 
 
 		 729 aa  321  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.42 
 
 		 729 aa  320  5e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.42 
 
 		 729 aa  320  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  30.42 
 
 		 729 aa  320  5e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.42 
 
 		 729 aa  320  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.42 
 
 		 729 aa  320  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  31.98 
 
 		 807 aa  320  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 729 aa  319  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.62 
 
 		 728 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 798 aa  318  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  31.81 
 
 		 808 aa  316  9e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 803 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  31.68 
 
 		 789 aa  307  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 722 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 840 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 717 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  31.05 
 
 		 802 aa  300  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 801 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 822 aa  296  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 819 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 722 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 824 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  30.55 
 
 		 817 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  30.44 
 
 		 810 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 778 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 703 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  32.16 
 
 		 812 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 765 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>