More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0279 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  69.76 
 
 		 723 aa  1026    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  100 
 
 		 723 aa  1462    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  45.12 
 
 		 764 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  44.99 
 
 		 742 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  44.67 
 
 		 732 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  44.67 
 
 		 733 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  42.93 
 
 		 745 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  43.75 
 
 		 732 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  42.93 
 
 		 745 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  44.44 
 
 		 746 aa  596  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  42.66 
 
 		 745 aa  592  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  43.08 
 
 		 726 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  43.08 
 
 		 726 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  43.08 
 
 		 726 aa  570  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  40.45 
 
 		 808 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  40.45 
 
 		 817 aa  515  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  40.03 
 
 		 808 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 698 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 751 aa  328  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 758 aa  313  5.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  30.12 
 
 		 755 aa  279  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  28.97 
 
 		 816 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  29.21 
 
 		 813 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 738 aa  248  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  28.34 
 
 		 709 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 849 aa  240  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 843 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  29.1 
 
 		 812 aa  231  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  27.56 
 
 		 714 aa  231  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 710 aa  224  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 717 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 697 aa  217  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 723 aa  217  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 716 aa  211  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 839 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 723 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 723 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 725 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 725 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 725 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 725 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 723 aa  201  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 718 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 700 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  28.23 
 
 		 724 aa  187  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  28.47 
 
 		 721 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 701 aa  183  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  27.37 
 
 		 704 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  26.67 
 
 		 713 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 701 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  26.1 
 
 		 713 aa  181  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 721 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 753 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 704 aa  171  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 783 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  25.56 
 
 		 771 aa  160  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 809 aa  157  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 739 aa  140  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 728 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 716 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  32.96 
 
 		 332 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 817 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0719  TonB-dependent receptor, putative  23.11 
 
 		 747 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 		 613 aa  81.6  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.52 
 
 		 755 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 634 aa  77.4  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  31.37 
 
 		 617 aa  77.4  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 736 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  29.59 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  35.03 
 
 		 677 aa  75.1  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  31.92 
 
 		 618 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 681 aa  73.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 617 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 764 aa  72  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 707 aa  71.6  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.49 
 
 		 647 aa  71.6  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 649 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 791 aa  70.1  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  36.16 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  33.33 
 
 		 676 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 722 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 688 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  31.25 
 
 		 718 aa  68.6  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 593 aa  68.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 679 aa  67.8  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  26.89 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  21.2 
 
 		 661 aa  67.4  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 625 aa  67.4  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 686 aa  67.4  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 727 aa  67  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  30.59 
 
 		 638 aa  67  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 737 aa  67  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 642 aa  67  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  27.87 
 
 		 677 aa  67  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 682 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  28.79 
 
 		 675 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 742 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 701 aa  65.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>