More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1056 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  49.49 
 
 		 817 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  49.34 
 
 		 808 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 698 aa  1415    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  49.64 
 
 		 808 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  43.47 
 
 		 742 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  42.82 
 
 		 764 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  39.52 
 
 		 745 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  39.52 
 
 		 745 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  39.38 
 
 		 745 aa  512  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  38.93 
 
 		 746 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  38.61 
 
 		 723 aa  463  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  38.14 
 
 		 726 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  38.14 
 
 		 726 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  38.21 
 
 		 732 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  37.95 
 
 		 723 aa  458  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  38.14 
 
 		 726 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  39.58 
 
 		 733 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  38.52 
 
 		 732 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 758 aa  280  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 751 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  27.26 
 
 		 755 aa  241  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.47 
 
 		 709 aa  223  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 718 aa  213  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 849 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  27.39 
 
 		 813 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  27.25 
 
 		 816 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 738 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 843 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 725 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 725 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 725 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 725 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 839 aa  184  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 723 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 723 aa  180  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 723 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 723 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 701 aa  173  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  25.47 
 
 		 812 aa  171  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 721 aa  171  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 700 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 701 aa  167  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  25.77 
 
 		 714 aa  164  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  26.8 
 
 		 704 aa  161  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 697 aa  160  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 783 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  27.7 
 
 		 713 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 716 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 704 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 753 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 710 aa  144  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 809 aa  140  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  24.38 
 
 		 717 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 739 aa  137  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 724 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  25 
 
 		 771 aa  134  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  24.65 
 
 		 721 aa  130  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 716 aa  127  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  22.97 
 
 		 713 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  28.43 
 
 		 332 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 728 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  23.4 
 
 		 817 aa  104  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 634 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 675 aa  78.2  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  22.22 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  40.88 
 
 		 677 aa  76.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 736 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 764 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  31.55 
 
 		 675 aa  72.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 706 aa  72  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  33.15 
 
 		 647 aa  71.6  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 742 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 649 aa  71.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 613 aa  71.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.45 
 
 		 646 aa  71.2  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 628 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 683 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 707 aa  69.3  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  35.08 
 
 		 638 aa  67.8  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 762 aa  68.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 686 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  33.99 
 
 		 656 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 642 aa  66.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.04 
 
 		 691 aa  66.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.96 
 
 		 676 aa  65.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 737 aa  65.1  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  26.99 
 
 		 645 aa  64.7  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 		 841 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 698 aa  64.3  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  35.46 
 
 		 650 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 841 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  35.46 
 
 		 650 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  35.46 
 
 		 650 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  34.96 
 
 		 753 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000416689  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 750 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  23.38 
 
 		 698 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 681 aa  63.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  35.46 
 
 		 650 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  34.96 
 
 		 750 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  35.46 
 
 		 650 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>