More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0587 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 753 aa  1542    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 718 aa  234  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 701 aa  232  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 697 aa  230  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 849 aa  216  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 701 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 700 aa  205  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  26.79 
 
 		 713 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  27.13 
 
 		 721 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 704 aa  201  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 738 aa  201  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 721 aa  201  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 723 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 725 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 725 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 725 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 723 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 817 aa  196  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 723 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  26.88 
 
 		 717 aa  196  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 725 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 758 aa  195  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 783 aa  194  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 716 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 723 aa  189  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  27.62 
 
 		 713 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 710 aa  183  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 739 aa  178  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 809 aa  177  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  25.1 
 
 		 723 aa  172  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  25.78 
 
 		 704 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  25.46 
 
 		 771 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  25.98 
 
 		 723 aa  167  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  24.62 
 
 		 813 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  24.93 
 
 		 724 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  25.16 
 
 		 745 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 745 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  24.46 
 
 		 816 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 742 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 764 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 745 aa  154  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 		 817 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 843 aa  150  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  24.54 
 
 		 812 aa  149  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  24.5 
 
 		 755 aa  147  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 808 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 698 aa  144  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 716 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  22.82 
 
 		 839 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  31.06 
 
 		 332 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 728 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 732 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  29.81 
 
 		 714 aa  119  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  23.34 
 
 		 733 aa  115  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 751 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 726 aa  112  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  21.39 
 
 		 709 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  23.06 
 
 		 732 aa  110  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 808 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 726 aa  110  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 726 aa  110  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  22.55 
 
 		 746 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.6 
 
 		 639 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  24.05 
 
 		 739 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 837 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.05 
 
 		 676 aa  63.9  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  21.21 
 
 		 661 aa  63.2  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  28.7 
 
 		 706 aa  63.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.36 
 
 		 663 aa  61.6  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  21.8 
 
 		 663 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 698 aa  61.2  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.76 
 
 		 630 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.3 
 
 		 646 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.76 
 
 		 630 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 715 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 634 aa  58.9  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  36.31 
 
 		 647 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.24 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  26.15 
 
 		 638 aa  58.9  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  21.92 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  21.54 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 744 aa  57.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.24 
 
 		 666 aa  57.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 688 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 643 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 651 aa  57  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  22.43 
 
 		 652 aa  57.4  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0132  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 679 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.691558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.24 
 
 		 666 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 736 aa  57  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1673  receptor, putative  32.02 
 
 		 639 aa  56.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.193509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 707 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 726 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0439  hypothetical protein  32.2 
 
 		 670 aa  56.6  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.447441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.01 
 
 		 631 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  32.96 
 
 		 677 aa  56.2  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 634 aa  56.6  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 715 aa  55.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>