More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2402 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  66.99 
 
 		 721 aa  1008    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  60.09 
 
 		 704 aa  872    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  60.28 
 
 		 710 aa  890    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 724 aa  1480    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  58.46 
 
 		 717 aa  855    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  57.4 
 
 		 716 aa  862    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  55.62 
 
 		 713 aa  815    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  39.89 
 
 		 783 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  38.05 
 
 		 817 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  31.73 
 
 		 771 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 849 aa  302  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 738 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 697 aa  294  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  30.91 
 
 		 713 aa  291  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 700 aa  280  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 721 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 723 aa  268  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 723 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 725 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 725 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 725 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 725 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 723 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 723 aa  257  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 701 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 701 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 718 aa  253  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 704 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 809 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 739 aa  209  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 758 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  28.23 
 
 		 723 aa  198  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  26.12 
 
 		 714 aa  198  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 839 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 728 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  25.47 
 
 		 709 aa  185  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 751 aa  184  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  26.71 
 
 		 732 aa  183  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 		 732 aa  182  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  35.78 
 
 		 332 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 716 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 843 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  26.73 
 
 		 733 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 753 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  27.17 
 
 		 723 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 		 746 aa  167  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  25.21 
 
 		 813 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  25.74 
 
 		 816 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  25.36 
 
 		 812 aa  164  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 764 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 742 aa  161  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 726 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 726 aa  158  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 		 755 aa  157  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 726 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 745 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 698 aa  150  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 745 aa  150  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 745 aa  146  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 		 808 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 		 808 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 		 817 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  32 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2929  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.32 
 
 		 755 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.56728  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 764 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  23.05 
 
 		 663 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  31.98 
 
 		 746 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  31.84 
 
 		 746 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  22.36 
 
 		 666 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  26.24 
 
 		 693 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  27.31 
 
 		 646 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.37 
 
 		 663 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  21.38 
 
 		 666 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  21.38 
 
 		 666 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  21.76 
 
 		 666 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 759 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 736 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  21.79 
 
 		 666 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 649 aa  72  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 706 aa  71.2  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  34.03 
 
 		 665 aa  71.6  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  30.43 
 
 		 618 aa  71.2  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 678 aa  71.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  33.86 
 
 		 655 aa  70.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  34.01 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  34.01 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  34.01 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  34.01 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  34.01 
 
 		 650 aa  70.5  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.73 
 
 		 631 aa  70.5  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 665 aa  70.5  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 634 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  31.97 
 
 		 641 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  31.97 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  36.73 
 
 		 695 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  31.97 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  31.97 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  29.34 
 
 		 675 aa  69.7  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  31.97 
 
 		 659 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>