More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3178 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  66.99 
 
 		 726 aa  1012    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  48.76 
 
 		 764 aa  665    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  66.85 
 
 		 726 aa  1006    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  68.18 
 
 		 746 aa  1038    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  48.35 
 
 		 745 aa  700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  100 
 
 		 733 aa  1496    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  48.48 
 
 		 745 aa  704    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  66.99 
 
 		 726 aa  1012    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  49.18 
 
 		 742 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  47.93 
 
 		 745 aa  698    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  89.34 
 
 		 732 aa  1354    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  88.52 
 
 		 732 aa  1355    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  44.67 
 
 		 723 aa  598  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  43.98 
 
 		 723 aa  578  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  39.75 
 
 		 817 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  39.61 
 
 		 808 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  39.41 
 
 		 808 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  39.58 
 
 		 698 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 758 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 751 aa  306  9.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  32.15 
 
 		 816 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  32.01 
 
 		 813 aa  303  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  31.77 
 
 		 755 aa  282  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 843 aa  278  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 849 aa  268  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  30.18 
 
 		 812 aa  266  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 738 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 839 aa  253  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.93 
 
 		 709 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 697 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  26.98 
 
 		 714 aa  209  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 716 aa  204  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 725 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 725 aa  200  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 725 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 723 aa  198  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 718 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 725 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 710 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  27.09 
 
 		 717 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 704 aa  195  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 723 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 701 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 723 aa  191  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 723 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  26.89 
 
 		 713 aa  182  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  25.56 
 
 		 721 aa  175  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  25.6 
 
 		 771 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 721 aa  171  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 716 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 700 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  26.04 
 
 		 704 aa  167  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  27.12 
 
 		 724 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 809 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  25.3 
 
 		 713 aa  157  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 739 aa  153  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 728 aa  144  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 783 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 753 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  28.12 
 
 		 332 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 817 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  27.27 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 675 aa  70.5  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 613 aa  69.7  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  23.4 
 
 		 718 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 634 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 736 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  30.39 
 
 		 628 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  30.25 
 
 		 659 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  30.25 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  30.25 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  30.25 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  30.25 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  30.25 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 707 aa  66.6  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  31.51 
 
 		 650 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  31.51 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 715 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  31.51 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  31.51 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  31.51 
 
 		 650 aa  65.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  29.63 
 
 		 656 aa  64.7  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.63 
 
 		 694 aa  64.3  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  32 
 
 		 718 aa  64.3  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 		 702 aa  63.9  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  32.37 
 
 		 641 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 783 aa  63.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 634 aa  63.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.32 
 
 		 618 aa  63.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  23.24 
 
 		 690 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  26.69 
 
 		 660 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.23 
 
 		 630 aa  62  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 749 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  26.69 
 
 		 660 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 762 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  31.5 
 
 		 661 aa  61.6  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 617 aa  61.6  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  23.46 
 
 		 702 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>