More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0587 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  100 
 
 		 771 aa  1575    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  36.58 
 
 		 783 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 817 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  34.65 
 
 		 849 aa  348  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 710 aa  336  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 697 aa  331  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  33.14 
 
 		 721 aa  330  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  32.29 
 
 		 717 aa  325  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 716 aa  323  7e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 738 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  32.03 
 
 		 713 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  32.44 
 
 		 724 aa  299  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  30.24 
 
 		 704 aa  293  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 839 aa  253  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  30.98 
 
 		 812 aa  244  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 701 aa  242  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  29.25 
 
 		 813 aa  241  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 700 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 704 aa  239  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  29.97 
 
 		 816 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 701 aa  232  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 739 aa  232  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 809 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  27.98 
 
 		 713 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 843 aa  222  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 718 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 723 aa  220  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 721 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 725 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 723 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 725 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  29.23 
 
 		 714 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 725 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 723 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 723 aa  211  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 725 aa  211  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 716 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  27.82 
 
 		 709 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 728 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 758 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  25.37 
 
 		 732 aa  181  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 732 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  25.6 
 
 		 733 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 746 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 753 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 726 aa  164  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 726 aa  162  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 726 aa  161  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  25.56 
 
 		 723 aa  160  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 751 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 		 745 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 745 aa  151  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  25.46 
 
 		 755 aa  146  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 745 aa  146  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  24.58 
 
 		 723 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 698 aa  134  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 764 aa  125  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 742 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 808 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 817 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  23.68 
 
 		 808 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  30.6 
 
 		 332 aa  106  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 785 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.57 
 
 		 631 aa  64.7  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.34 
 
 		 614 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.34 
 
 		 614 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.34 
 
 		 614 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.34 
 
 		 614 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.34 
 
 		 614 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 817 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.62 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 791 aa  61.6  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.9 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.9 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.9 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.9 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.9 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  31.72 
 
 		 777 aa  60.8  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  41.05 
 
 		 650 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  41.05 
 
 		 650 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  41.05 
 
 		 650 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  41.05 
 
 		 650 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 764 aa  60.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  41.05 
 
 		 650 aa  60.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 854 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  29.1 
 
 		 618 aa  59.7  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.07 
 
 		 631 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  26.32 
 
 		 979 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  39.58 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  38.95 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  38.95 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  38.95 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  38.95 
 
 		 659 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  38.95 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  38.95 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.79 
 
 		 623 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  38.95 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.52 
 
 		 630 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.52 
 
 		 630 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  38.95 
 
 		 641 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>