More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0468 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  49.93 
 
 		 704 aa  706    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  51.65 
 
 		 701 aa  758    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  51.79 
 
 		 701 aa  761    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  50.7 
 
 		 721 aa  701    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 700 aa  1424    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  40.22 
 
 		 718 aa  532  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  41.79 
 
 		 725 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  41.79 
 
 		 725 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  41.79 
 
 		 725 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  41.64 
 
 		 725 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  41.27 
 
 		 723 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  40.92 
 
 		 723 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  40.81 
 
 		 809 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  40.69 
 
 		 723 aa  502  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  40.55 
 
 		 723 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 716 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  37.17 
 
 		 713 aa  429  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 728 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 849 aa  309  9e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  30.87 
 
 		 717 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 716 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 710 aa  301  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 783 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  31.93 
 
 		 704 aa  291  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  31.35 
 
 		 721 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 697 aa  288  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 738 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  32.27 
 
 		 724 aa  269  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 817 aa  267  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  28.93 
 
 		 713 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  30.39 
 
 		 714 aa  249  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  40.3 
 
 		 332 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  28.55 
 
 		 771 aa  246  8e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 843 aa  238  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 739 aa  233  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  27.75 
 
 		 813 aa  231  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  27.43 
 
 		 816 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.14 
 
 		 709 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 839 aa  220  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 753 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  26.32 
 
 		 812 aa  205  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  27.87 
 
 		 723 aa  205  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 751 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  26.75 
 
 		 732 aa  193  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 732 aa  189  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 758 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 742 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 726 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  25.81 
 
 		 723 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 764 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 726 aa  182  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 726 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 808 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 746 aa  178  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 817 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 745 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  25.33 
 
 		 733 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 698 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 745 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 808 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 745 aa  169  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 755 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  23.49 
 
 		 693 aa  101  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  24.12 
 
 		 698 aa  84  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 688 aa  77.4  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 689 aa  76.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  23.2 
 
 		 647 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  25.65 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 675 aa  71.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 699 aa  71.2  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.46 
 
 		 681 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.09 
 
 		 652 aa  70.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.29 
 
 		 666 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  27.97 
 
 		 690 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  33.12 
 
 		 655 aa  67.4  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.09 
 
 		 688 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.29 
 
 		 666 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.54 
 
 		 696 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  20.7 
 
 		 728 aa  67  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.02 
 
 		 695 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.37 
 
 		 695 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  24.12 
 
 		 712 aa  66.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.91 
 
 		 666 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 751 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  23.91 
 
 		 666 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.57 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  21.54 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  23.63 
 
 		 769 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 698 aa  63.9  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.35 
 
 		 754 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 701 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.25 
 
 		 666 aa  63.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 706 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 736 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 710 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.15 
 
 		 775 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 724 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.42 
 
 		 861 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  23 
 
 		 676 aa  61.6  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>