More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0745 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  98.81 
 
 		 758 aa  1537    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  98.55 
 
 		 758 aa  1535    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  83.91 
 
 		 758 aa  1347    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 758 aa  1557    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  98.94 
 
 		 758 aa  1541    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  37.8 
 
 		 821 aa  524  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  38.68 
 
 		 706 aa  479  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 744 aa  475  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  35.81 
 
 		 797 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 835 aa  449  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  34.99 
 
 		 801 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 751 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 689 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  37.03 
 
 		 689 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  35.91 
 
 		 687 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 682 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 734 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  35.84 
 
 		 687 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 680 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 727 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 681 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  34.89 
 
 		 685 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 694 aa  363  6e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  36.03 
 
 		 681 aa  360  7e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 681 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 719 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 692 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 677 aa  350  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 693 aa  350  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 730 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  33.28 
 
 		 694 aa  346  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 742 aa  343  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 677 aa  342  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.82 
 
 		 600 aa  342  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 724 aa  340  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 751 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 698 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 698 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 681 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 681 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 751 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 698 aa  337  5e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 693 aa  332  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 725 aa  330  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 695 aa  328  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 705 aa  327  7e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 709 aa  321  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  31.59 
 
 		 709 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 695 aa  305  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 685 aa  299  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 709 aa  295  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 699 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  28.96 
 
 		 778 aa  289  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 713 aa  281  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 702 aa  275  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 733 aa  266  8.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 727 aa  266  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  31.67 
 
 		 685 aa  262  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 708 aa  261  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  27.45 
 
 		 744 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 714 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 705 aa  249  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 702 aa  248  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 707 aa  247  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 676 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 719 aa  243  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 719 aa  243  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 714 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 783 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 731 aa  229  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 723 aa  228  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  29.5 
 
 		 782 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  29 
 
 		 774 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 759 aa  211  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 784 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 702 aa  201  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 784 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 789 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 799 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 766 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 763 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  40.08 
 
 		 836 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 735 aa  157  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 818 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  45.68 
 
 		 249 aa  140  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  35.27 
 
 		 868 aa  118  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 776 aa  114  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 678 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 780 aa  91.7  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  20.9 
 
 		 776 aa  91.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 797 aa  87.4  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 685 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 732 aa  84.3  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  28.18 
 
 		 776 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 730 aa  81.3  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 698 aa  80.5  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 824 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 718 aa  79  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 747 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>