More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2033 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  98.56 
 
 		 693 aa  1278    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 695 aa  1401    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  66.31 
 
 		 730 aa  855    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  49.86 
 
 		 682 aa  594  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  38.76 
 
 		 689 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  35.7 
 
 		 689 aa  379  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 734 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 681 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  36.02 
 
 		 687 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  35.88 
 
 		 687 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 680 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 758 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  34.34 
 
 		 758 aa  360  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  34.2 
 
 		 758 aa  360  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 682 aa  360  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 821 aa  359  8e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 685 aa  359  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  37.44 
 
 		 681 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  34.05 
 
 		 758 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  33.91 
 
 		 758 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  37.3 
 
 		 681 aa  356  8.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 835 aa  355  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 694 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 719 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 706 aa  347  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 727 aa  347  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  36.39 
 
 		 685 aa  345  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 751 aa  342  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 727 aa  335  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 744 aa  334  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  28.21 
 
 		 868 aa  333  8e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  31.56 
 
 		 709 aa  333  9e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.2 
 
 		 600 aa  331  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 797 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 692 aa  325  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 694 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 724 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 709 aa  322  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 693 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 742 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 677 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 677 aa  317  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  29.58 
 
 		 801 aa  316  8e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 751 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 702 aa  313  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 698 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 725 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 751 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 698 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 713 aa  313  9e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 681 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 681 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 698 aa  312  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 699 aa  306  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 709 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 695 aa  297  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 705 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 733 aa  287  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 719 aa  287  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 719 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 714 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  28.42 
 
 		 778 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 685 aa  281  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 708 aa  281  4e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  29.64 
 
 		 744 aa  280  5e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 676 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 702 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 707 aa  272  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 714 aa  266  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 705 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 723 aa  261  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 731 aa  261  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 783 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 702 aa  239  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  29.04 
 
 		 774 aa  229  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 784 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  28.47 
 
 		 782 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 784 aa  220  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 799 aa  219  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 789 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 836 aa  196  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 766 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 759 aa  171  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 763 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 735 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 249 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 776 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 776 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  24.6 
 
 		 764 aa  108  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  24.75 
 
 		 764 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 824 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 732 aa  98.6  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  22.35 
 
 		 776 aa  94.7  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 818 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.47 
 
 		 681 aa  89.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 797 aa  89.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.87 
 
 		 695 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 678 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 801 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  25.9 
 
 		 811 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>