100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1607 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1607  outer membrane protein, TonB-dependent receptor  100 
 
 		 641 aa  1317    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497868  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 667 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5793  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 626 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4100  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 630 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0091  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 607 aa  173  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12508  putative TonB-dependent outer membrane receptor  26.11 
 
 		 612 aa  165  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1918  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 687 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138807  normal  0.178557 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  20.44 
 
 		 666 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3941  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 670 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  0.35768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1875  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 681 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  23.14 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 619 aa  76.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  23.04 
 
 		 617 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 632 aa  74.7  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  22.09 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 638 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 648 aa  66.6  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 629 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 668 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  22.48 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  20.47 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3572  TonB-dependent receptor plug  20.13 
 
 		 653 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102808  normal  0.0129675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  23.18 
 
 		 611 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  21.79 
 
 		 664 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  20.95 
 
 		 622 aa  60.8  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 634 aa  60.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  19.77 
 
 		 679 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  21.37 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.13 
 
 		 623 aa  58.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 629 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 611 aa  57  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 686 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 709 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.35 
 
 		 613 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  20.59 
 
 		 602 aa  55.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  21.32 
 
 		 649 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 651 aa  54.7  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 642 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 642 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 642 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 642 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 642 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 737 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 628 aa  52.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  21.76 
 
 		 623 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  20.44 
 
 		 612 aa  52.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  25.74 
 
 		 652 aa  52.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.68 
 
 		 631 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 611 aa  51.2  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2526  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 620 aa  50.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  20.54 
 
 		 671 aa  50.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 678 aa  50.4  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 651 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 735 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  27.52 
 
 		 617 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  25.58 
 
 		 623 aa  49.7  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.38 
 
 		 646 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  23.15 
 
 		 649 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 613 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  23.85 
 
 		 611 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  21.06 
 
 		 712 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  21.46 
 
 		 650 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  22.26 
 
 		 647 aa  47.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 649 aa  47.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  19.38 
 
 		 807 aa  47.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 737 aa  47.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  20.89 
 
 		 649 aa  47.4  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  25.79 
 
 		 621 aa  47.4  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25 
 
 		 639 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  21.84 
 
 		 769 aa  47  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  20.84 
 
 		 633 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  20.44 
 
 		 626 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  29.67 
 
 		 735 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 736 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  22.96 
 
 		 650 aa  46.6  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 651 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  19.49 
 
 		 613 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 618 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  20.72 
 
 		 680 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.35 
 
 		 653 aa  45.8  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  22.54 
 
 		 628 aa  45.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  20.67 
 
 		 626 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 836 aa  45.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 699 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 632 aa  45.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  23.87 
 
 		 677 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 593 aa  45.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  23.92 
 
 		 631 aa  45.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  19.02 
 
 		 602 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 625 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 747 aa  44.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 624 aa  44.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 697 aa  44.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 650 aa  44.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 833 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 665 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  19.87 
 
 		 617 aa  44.3  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  28.36 
 
 		 620 aa  43.9  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.98 
 
 		 704 aa  44.3  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 669 aa  43.9  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>