192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12508 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12508  putative TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 612 aa  1239    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0091  TonB-dependent receptor  38.09 
 
 		 607 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1607  outer membrane protein, TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 641 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497868  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5793  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 626 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.77 
 
 		 616 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  23.59 
 
 		 617 aa  92.8  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4100  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 		 630 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  22.46 
 
 		 628 aa  87.8  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 602 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 698 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  21.07 
 
 		 619 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  23.97 
 
 		 620 aa  81.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  21.62 
 
 		 627 aa  80.1  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 697 aa  76.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 619 aa  74.3  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  21.61 
 
 		 685 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  21.98 
 
 		 680 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  26.39 
 
 		 622 aa  71.6  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 615 aa  71.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  21.14 
 
 		 628 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  23.46 
 
 		 621 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  21.53 
 
 		 634 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  21.61 
 
 		 685 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 667 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  21.7 
 
 		 821 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  21.45 
 
 		 685 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  21.45 
 
 		 685 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  21.45 
 
 		 685 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  21.45 
 
 		 685 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  22.1 
 
 		 649 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  21.25 
 
 		 627 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1875  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  21.97 
 
 		 647 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  20.35 
 
 		 666 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 618 aa  64.3  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 686 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 705 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  28.38 
 
 		 617 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 621 aa  62  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 673 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  23.49 
 
 		 613 aa  61.6  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2526  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 620 aa  60.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 613 aa  59.7  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 629 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 626 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3941  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 670 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  0.35768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.1 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 693 aa  58.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 735 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 627 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  28.66 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 670 aa  58.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  19.4 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  27.37 
 
 		 623 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  20.94 
 
 		 653 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 621 aa  57  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 621 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.97 
 
 		 646 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 638 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 653 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 602 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  23.66 
 
 		 618 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  21.25 
 
 		 671 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 593 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 641 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 662 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.06 
 
 		 614 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 624 aa  55.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.03 
 
 		 614 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.03 
 
 		 614 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.03 
 
 		 614 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 642 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 642 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  26.03 
 
 		 668 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 642 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.06 
 
 		 614 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 634 aa  54.3  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 669 aa  54.3  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 665 aa  54.3  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  32.81 
 
 		 638 aa  54.3  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 651 aa  54.3  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 688 aa  53.9  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 652 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 682 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  24.62 
 
 		 623 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  21.37 
 
 		 620 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  21.13 
 
 		 653 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 629 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 632 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 642 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  21.28 
 
 		 649 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 642 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 690 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3790  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.21 
 
 		 716 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 656 aa  52.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>