149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5793 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5793  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 626 aa  1276    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4100  TonB-dependent receptor  53.07 
 
 		 630 aa  659    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1607  outer membrane protein, TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 641 aa  181  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497868  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 667 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12508  putative TonB-dependent outer membrane receptor  25.17 
 
 		 612 aa  118  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 613 aa  88.2  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0091  TonB-dependent receptor  37.68 
 
 		 607 aa  88.2  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 666 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  23.08 
 
 		 622 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 668 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  24.59 
 
 		 645 aa  73.9  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1875  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 681 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 611 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  24.43 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 664 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 629 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  20.92 
 
 		 618 aa  66.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.55 
 
 		 614 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 627 aa  63.9  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  21.45 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  23.56 
 
 		 623 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 629 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 612 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.61 
 
 		 615 aa  63.5  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  25.06 
 
 		 628 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.75 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  22.93 
 
 		 631 aa  62.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.38 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  35.29 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.75 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.75 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 638 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.75 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  41.1 
 
 		 642 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  41.1 
 
 		 642 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  41.1 
 
 		 642 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  41.43 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  41.43 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1918  TonB-dependent receptor  19.88 
 
 		 687 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138807  normal  0.178557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 680 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.27 
 
 		 614 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  23.12 
 
 		 621 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  36.04 
 
 		 735 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 801 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  25.06 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.69 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.69 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  21.54 
 
 		 624 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 634 aa  58.9  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.44 
 
 		 614 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.31 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.5 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  38.36 
 
 		 617 aa  57.8  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  39.73 
 
 		 628 aa  57.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  39.73 
 
 		 616 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.44 
 
 		 614 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 624 aa  56.2  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 619 aa  56.2  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 602 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  38.89 
 
 		 631 aa  55.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 624 aa  55.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  35 
 
 		 616 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.13 
 
 		 630 aa  54.7  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.13 
 
 		 630 aa  54.7  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  21.36 
 
 		 617 aa  54.3  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 593 aa  54.7  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  31.86 
 
 		 611 aa  54.3  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 641 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 616 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 634 aa  53.9  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.43 
 
 		 619 aa  53.9  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  23.86 
 
 		 627 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  38.03 
 
 		 617 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  23.88 
 
 		 639 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  21.39 
 
 		 646 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 650 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.78 
 
 		 623 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 692 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  36.11 
 
 		 1023 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  41.43 
 
 		 695 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  24.32 
 
 		 611 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3941  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 670 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  0.35768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 686 aa  51.6  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 698 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 627 aa  51.2  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 698 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 632 aa  50.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  34.41 
 
 		 626 aa  51.2  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  38.89 
 
 		 671 aa  50.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 626 aa  50.4  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 697 aa  50.4  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  31.63 
 
 		 620 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 642 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.13 
 
 		 631 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  31.25 
 
 		 680 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 618 aa  50.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  37.14 
 
 		 673 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  39.13 
 
 		 631 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>