263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1875 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1875  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 681 aa  1411    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1918  TonB-dependent receptor  49.78 
 
 		 687 aa  686    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138807  normal  0.178557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3941  TonB-dependent receptor  47.5 
 
 		 670 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  0.35768 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  21.37 
 
 		 667 aa  106  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  23.26 
 
 		 634 aa  91.3  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0091  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 607 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  22.45 
 
 		 645 aa  87  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  21.05 
 
 		 709 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 628 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  20.03 
 
 		 618 aa  84.3  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 624 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  20.3 
 
 		 623 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.39 
 
 		 616 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.11 
 
 		 630 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.11 
 
 		 630 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 694 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  20.24 
 
 		 680 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1607  outer membrane protein, TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 641 aa  75.1  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497868  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.54 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.62 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.62 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 632 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  21.24 
 
 		 623 aa  73.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.62 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.47 
 
 		 614 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 737 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  20.8 
 
 		 648 aa  70.9  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  20.33 
 
 		 623 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 1128 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.26 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 705 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 647 aa  68.2  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.37 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  20.58 
 
 		 621 aa  67  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.58 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 657 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 602 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  20.42 
 
 		 615 aa  66.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 697 aa  66.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5793  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12508  putative TonB-dependent outer membrane receptor  22.84 
 
 		 612 aa  65.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  20.66 
 
 		 638 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  24.62 
 
 		 650 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  23.51 
 
 		 620 aa  63.9  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  20.54 
 
 		 641 aa  63.9  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 735 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  21.99 
 
 		 636 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 632 aa  62.4  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  20.63 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  22.78 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 651 aa  61.6  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 649 aa  62  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 641 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  21.31 
 
 		 622 aa  61.6  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 617 aa  61.2  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  29.57 
 
 		 623 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 661 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  21.87 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  23.18 
 
 		 611 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 642 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 742 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 642 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 642 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 628 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  24.24 
 
 		 640 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  19.77 
 
 		 618 aa  59.3  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1228  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0002097  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  20.74 
 
 		 697 aa  59.7  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  23.13 
 
 		 664 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  27.6 
 
 		 767 aa  58.9  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 627 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  20.24 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  23.48 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  34.48 
 
 		 822 aa  57.8  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  26.76 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.08 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.55 
 
 		 613 aa  57.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 666 aa  57.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 		 627 aa  57.4  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  21.21 
 
 		 617 aa  57.4  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 731 aa  57  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 642 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  20.44 
 
 		 628 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 673 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 713 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  21.62 
 
 		 661 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  19.97 
 
 		 671 aa  56.2  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5776  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 779 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  29.63 
 
 		 626 aa  56.6  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  26.06 
 
 		 652 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4100  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 630 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 668 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 624 aa  55.1  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  20.82 
 
 		 821 aa  54.7  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  22.02 
 
 		 712 aa  54.3  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>