217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1918 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3941  TonB-dependent receptor  50.54 
 
 		 670 aa  666    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  0.35768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1918  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 687 aa  1415    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138807  normal  0.178557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1875  TonB-dependent receptor  49.78 
 
 		 681 aa  686    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 667 aa  111  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.49 
 
 		 616 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1607  outer membrane protein, TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 641 aa  92  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497868  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0091  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 607 aa  90.9  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.14 
 
 		 623 aa  83.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  22.19 
 
 		 617 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 602 aa  83.2  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.77 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 634 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 709 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.47 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.47 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.47 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.45 
 
 		 630 aa  77.8  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.45 
 
 		 630 aa  77.8  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.16 
 
 		 614 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.31 
 
 		 614 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.76 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.76 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  21.45 
 
 		 673 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.76 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.76 
 
 		 614 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  22.61 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.65 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.61 
 
 		 615 aa  73.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.27 
 
 		 619 aa  70.9  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.17 
 
 		 631 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 642 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  21.87 
 
 		 615 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  23.46 
 
 		 645 aa  68.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  21.84 
 
 		 611 aa  68.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  22.33 
 
 		 661 aa  68.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 628 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 791 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  36.46 
 
 		 617 aa  66.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  22.67 
 
 		 618 aa  64.3  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 612 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 621 aa  63.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  21.49 
 
 		 1023 aa  63.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  21.63 
 
 		 611 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  21.38 
 
 		 624 aa  62  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 632 aa  62  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 627 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  19.29 
 
 		 698 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 697 aa  60.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 697 aa  60.1  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 634 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5793  TonB-dependent receptor plug  19.85 
 
 		 626 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128664 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  24.28 
 
 		 620 aa  58.9  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 737 aa  58.9  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 682 aa  58.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 654 aa  58.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  21.15 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 641 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 742 aa  57.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 772 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  24.62 
 
 		 797 aa  57.4  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 665 aa  57.4  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  24.52 
 
 		 621 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  29.17 
 
 		 623 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 694 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 627 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 642 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5776  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 779 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 		 652 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 628 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1358  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 626 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00131062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 640 aa  56.6  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 624 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 735 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 649 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.87 
 
 		 631 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 828 aa  55.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  24.5 
 
 		 611 aa  55.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 642 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 642 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 670 aa  55.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 638 aa  55.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 642 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.38 
 
 		 613 aa  54.7  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 618 aa  54.7  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.82 
 
 		 631 aa  54.3  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 655 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1228  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 623 aa  53.9  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0002097  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 713 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  23.81 
 
 		 671 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4100  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 630 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 611 aa  53.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  24.34 
 
 		 712 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  24.61 
 
 		 650 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  25.81 
 
 		 636 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 616 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.85 
 
 		 728 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 683 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 688 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>