225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5776 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5776  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 779 aa  1507    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 666 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  23.1 
 
 		 613 aa  92  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 709 aa  81.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3572  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 653 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102808  normal  0.0129675 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 624 aa  77  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 798 aa  74.3  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 649 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  29.12 
 
 		 788 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 632 aa  72  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  28.57 
 
 		 782 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 638 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 626 aa  68.2  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  21.31 
 
 		 671 aa  68.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  35.37 
 
 		 621 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.92 
 
 		 1023 aa  66.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  21.66 
 
 		 797 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 624 aa  66.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 664 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  26.81 
 
 		 767 aa  65.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1117 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 713 aa  64.3  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  33.94 
 
 		 960 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 698 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.07 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  38.26 
 
 		 612 aa  62.4  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 668 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 823 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 736 aa  62  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  25.6 
 
 		 799 aa  61.6  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  22.87 
 
 		 617 aa  61.6  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  34.48 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 792 aa  62  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  34.55 
 
 		 628 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 617 aa  61.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.12 
 
 		 630 aa  60.8  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  29.76 
 
 		 620 aa  60.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 629 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 697 aa  60.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 611 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.57 
 
 		 646 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 615 aa  60.1  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 619 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  22 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  23.08 
 
 		 665 aa  60.1  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  28.77 
 
 		 623 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  21.65 
 
 		 634 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 627 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 775 aa  58.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.17 
 
 		 619 aa  57.8  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 649 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3941  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 670 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  0.35768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 641 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 772 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 613 aa  57.4  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.2 
 
 		 631 aa  57  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 680 aa  57  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  32.41 
 
 		 611 aa  57.4  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.73 
 
 		 616 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1875  TonB-dependent receptor  21.29 
 
 		 681 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 651 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 763 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  31.82 
 
 		 623 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 616 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  22.46 
 
 		 634 aa  55.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.49 
 
 		 631 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1918  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 687 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138807  normal  0.178557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 602 aa  55.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 628 aa  55.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.91 
 
 		 631 aa  55.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 628 aa  55.1  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 836 aa  55.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 621 aa  55.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  23.55 
 
 		 676 aa  54.7  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 628 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 627 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  25.75 
 
 		 781 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 593 aa  54.3  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 764 aa  54.3  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 800 aa  54.3  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 642 aa  54.3  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  25.64 
 
 		 661 aa  54.3  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 658 aa  53.5  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 614 aa  53.9  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 735 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  24.6 
 
 		 618 aa  53.9  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 642 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 742 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 702 aa  54.3  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  22.32 
 
 		 666 aa  54.3  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  28.68 
 
 		 638 aa  53.5  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 581 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.67 
 
 		 666 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  23.28 
 
 		 807 aa  52.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0721  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  28.41 
 
 		 640 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.67 
 
 		 666 aa  52.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>