More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3315 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 781 aa  1603    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 763 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  29.85 
 
 		 767 aa  338  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 791 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  31.41 
 
 		 788 aa  327  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  31.07 
 
 		 797 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1117 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  28.61 
 
 		 799 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 798 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 772 aa  301  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  27.35 
 
 		 960 aa  290  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  29.35 
 
 		 782 aa  289  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 792 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 823 aa  220  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.23 
 
 		 617 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 653 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  23.89 
 
 		 750 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 760 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 737 aa  68.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 698 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 686 aa  67  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 688 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 748 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 615 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  29.82 
 
 		 618 aa  66.6  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  26.26 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  25.75 
 
 		 677 aa  65.1  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 651 aa  65.1  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  30.15 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 734 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 747 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 650 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 763 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 641 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 733 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 688 aa  62.4  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  22.45 
 
 		 753 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  26.29 
 
 		 691 aa  62.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 649 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 664 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 666 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 597 aa  61.6  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 647 aa  61.2  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  26.58 
 
 		 623 aa  60.8  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  27.27 
 
 		 663 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 663 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  27.27 
 
 		 663 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  27.27 
 
 		 663 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 722 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 626 aa  60.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  27.27 
 
 		 663 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 626 aa  60.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  27.27 
 
 		 663 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  27.27 
 
 		 659 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  27.27 
 
 		 641 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  26.72 
 
 		 620 aa  60.1  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 697 aa  60.1  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  30.66 
 
 		 655 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1228  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0002097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  25.34 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 624 aa  59.3  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  28.21 
 
 		 622 aa  58.9  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  26.55 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 627 aa  59.3  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3572  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 653 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102808  normal  0.0129675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 720 aa  58.9  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 621 aa  58.9  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  24.91 
 
 		 833 aa  57.8  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.97 
 
 		 650 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.97 
 
 		 650 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.97 
 
 		 650 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 924 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.97 
 
 		 650 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  24.59 
 
 		 661 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.97 
 
 		 650 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 593 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  29.01 
 
 		 665 aa  57.4  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.22 
 
 		 646 aa  56.2  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 720 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  23.4 
 
 		 1023 aa  56.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  21.79 
 
 		 721 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 778 aa  55.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  25 
 
 		 616 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  24.86 
 
 		 706 aa  55.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  24.18 
 
 		 720 aa  55.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  26.25 
 
 		 665 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.28 
 
 		 631 aa  55.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  26.25 
 
 		 665 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 720 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 619 aa  55.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  26.25 
 
 		 665 aa  55.5  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5776  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 779 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.28 
 
 		 631 aa  55.1  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  26.53 
 
 		 614 aa  55.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>