264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0091 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0091  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 607 aa  1235    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12508  putative TonB-dependent outer membrane receptor  38.09 
 
 		 612 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1607  outer membrane protein, TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 641 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497868  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 628 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 667 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  22.62 
 
 		 616 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  21.99 
 
 		 617 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 632 aa  102  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.94 
 
 		 628 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3941  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 670 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783014  normal  0.35768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  23.01 
 
 		 622 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  23.57 
 
 		 620 aa  91.7  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1918  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 687 aa  90.9  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138807  normal  0.178557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4100  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 		 630 aa  90.9  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  22.82 
 
 		 645 aa  90.5  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1875  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 681 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5793  TonB-dependent receptor plug  37.68 
 
 		 626 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128664 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 697 aa  88.2  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  21.27 
 
 		 627 aa  88.2  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 648 aa  87.8  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  22 
 
 		 617 aa  87.4  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  21.15 
 
 		 631 aa  86.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 632 aa  85.9  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  21.85 
 
 		 639 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  23.68 
 
 		 623 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  24.58 
 
 		 617 aa  84.3  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 621 aa  84  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.51 
 
 		 616 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.12 
 
 		 613 aa  82  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 673 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  21.69 
 
 		 680 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  19.94 
 
 		 602 aa  80.5  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  22.75 
 
 		 623 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 627 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  22.2 
 
 		 656 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 665 aa  78.2  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 629 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25 
 
 		 1023 aa  77  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  20.87 
 
 		 611 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.31 
 
 		 619 aa  76.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  23.88 
 
 		 671 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 616 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  23.93 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  21.93 
 
 		 627 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 680 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 686 aa  71.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  21.18 
 
 		 611 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 620 aa  71.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  21.71 
 
 		 653 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  21.63 
 
 		 653 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  21.69 
 
 		 611 aa  70.9  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  21.15 
 
 		 613 aa  70.5  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  20.25 
 
 		 649 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  22.58 
 
 		 628 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  21.7 
 
 		 653 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  24.36 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 709 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2071  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 629 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00162344  hitchhiker  0.000156466 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  19.78 
 
 		 614 aa  69.7  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 698 aa  68.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  21.74 
 
 		 624 aa  68.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3572  TonB-dependent receptor plug  18.71 
 
 		 653 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102808  normal  0.0129675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 619 aa  67.4  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  22.16 
 
 		 661 aa  67  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 651 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  23.17 
 
 		 615 aa  67  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  20.72 
 
 		 653 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 642 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 637 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 690 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 593 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  22.7 
 
 		 597 aa  65.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 611 aa  64.3  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 642 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 735 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  22.33 
 
 		 659 aa  62.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  20.58 
 
 		 626 aa  62  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 645 aa  62  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 662 aa  62  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 665 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  20.58 
 
 		 626 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 707 aa  61.2  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 638 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  20.3 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  20.85 
 
 		 685 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.25 
 
 		 639 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  20.91 
 
 		 652 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.6 
 
 		 646 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 634 aa  59.7  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  22.08 
 
 		 618 aa  58.9  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 638 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  20.46 
 
 		 685 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>