More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6321 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6321  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 732 aa  1437    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1571  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 804 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.579738  normal  0.0739696 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02495  hypothetical protein  23.28 
 
 		 777 aa  136  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 759 aa  107  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  25.63 
 
 		 652 aa  98.6  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  21.96 
 
 		 735 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.78 
 
 		 656 aa  90.9  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.45 
 
 		 754 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  20.57 
 
 		 698 aa  89.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  25.16 
 
 		 650 aa  89  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  26.37 
 
 		 687 aa  88.2  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.24 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.08 
 
 		 650 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.08 
 
 		 650 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.08 
 
 		 650 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  24.35 
 
 		 659 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 698 aa  84  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 663 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.64 
 
 		 663 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.64 
 
 		 663 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  24.76 
 
 		 663 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.47 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.47 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  22.05 
 
 		 639 aa  80.9  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  24.63 
 
 		 641 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 627 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  24.4 
 
 		 661 aa  79.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.97 
 
 		 616 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  23.33 
 
 		 618 aa  77.8  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 669 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.86 
 
 		 688 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 617 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 641 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 628 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 		 722 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.43 
 
 		 619 aa  74.3  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  35.66 
 
 		 639 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 697 aa  73.9  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 768 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  33.33 
 
 		 647 aa  73.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 628 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  32.18 
 
 		 623 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.15 
 
 		 646 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  37.86 
 
 		 681 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.15 
 
 		 696 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 627 aa  72  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 727 aa  72  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.85 
 
 		 653 aa  71.2  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  29.55 
 
 		 764 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 680 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 775 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  27.27 
 
 		 712 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.13 
 
 		 689 aa  69.3  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 685 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  37.17 
 
 		 650 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 682 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  33.97 
 
 		 628 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  23.27 
 
 		 704 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 665 aa  68.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  34.27 
 
 		 673 aa  67.4  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 634 aa  66.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  30.07 
 
 		 613 aa  67  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.53 
 
 		 867 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 698 aa  66.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  30.88 
 
 		 764 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 688 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 714 aa  65.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 709 aa  65.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  33.52 
 
 		 722 aa  65.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  29.55 
 
 		 859 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 709 aa  65.1  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 737 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  23.05 
 
 		 676 aa  65.1  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  22.43 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  30.15 
 
 		 622 aa  64.7  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  22.43 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.78 
 
 		 734 aa  64.3  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  31.06 
 
 		 776 aa  64.3  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  32.49 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.33 
 
 		 862 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  26.77 
 
 		 739 aa  64.3  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.33 
 
 		 759 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.35 
 
 		 1023 aa  63.9  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  35.77 
 
 		 755 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 715 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  35.14 
 
 		 734 aa  63.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  30.34 
 
 		 862 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1138  TonB-dependent receptor plug  22.73 
 
 		 652 aa  63.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 709 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 789 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>