More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02495 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02495  hypothetical protein  100 
 
 		 777 aa  1589    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1571  TonB-dependent receptor  37.77 
 
 		 804 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.579738  normal  0.0739696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6321  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 		 732 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  26.33 
 
 		 712 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.56 
 
 		 681 aa  94.4  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.2 
 
 		 714 aa  94  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 735 aa  92.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 698 aa  88.6  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 679 aa  88.2  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.24 
 
 		 618 aa  86.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  23.98 
 
 		 659 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23.09 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.22 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  23.46 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  23.46 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  23.46 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  23.46 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  23.36 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  23.46 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  23.46 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.32 
 
 		 641 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  23.09 
 
 		 650 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  23.09 
 
 		 650 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  23.1 
 
 		 666 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 759 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5070  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.49 
 
 		 762 aa  80.1  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565094  normal  0.157746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.24 
 
 		 657 aa  78.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  21.63 
 
 		 688 aa  78.6  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 715 aa  78.2  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.65 
 
 		 750 aa  78.2  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.87 
 
 		 666 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.96 
 
 		 666 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.96 
 
 		 666 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  22.88 
 
 		 712 aa  77  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 729 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 692 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 652 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.8 
 
 		 616 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  20.91 
 
 		 713 aa  75.5  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 698 aa  75.5  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 694 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 677 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 742 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  22.75 
 
 		 687 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 683 aa  72.4  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.27 
 
 		 688 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 637 aa  72.4  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  27.36 
 
 		 676 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  23.14 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 724 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 891 aa  72  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 617 aa  72  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 677 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.76 
 
 		 755 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1111  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.87 
 
 		 754 aa  71.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.192516 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 693 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 649 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 706 aa  71.2  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 676 aa  71.2  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 726 aa  70.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.05 
 
 		 656 aa  70.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 751 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 624 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 628 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 751 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.22 
 
 		 646 aa  69.3  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 769 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.43 
 
 		 730 aa  69.3  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  31.21 
 
 		 929 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.16 
 
 		 696 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 		 647 aa  67.8  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  28.51 
 
 		 647 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.14 
 
 		 755 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  28.42 
 
 		 659 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3145  TonB-dependent receptor plug  21.43 
 
 		 787 aa  67.8  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  23.77 
 
 		 675 aa  67.4  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.38 
 
 		 631 aa  67  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 763 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.51 
 
 		 696 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 681 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 680 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.18 
 
 		 614 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  25.13 
 
 		 620 aa  66.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  30.87 
 
 		 859 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  33.78 
 
 		 861 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.9 
 
 		 653 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  28.79 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 725 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.94 
 
 		 767 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  34.29 
 
 		 611 aa  66.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.72 
 
 		 690 aa  66.6  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  37.06 
 
 		 743 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 686 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>