More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01786 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0396  TonB-dependent receptor  61.01 
 
 		 799 aa  939    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2956  TonB-dependent receptor  60.31 
 
 		 790 aa  972    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01786  putative TonB dependent receptor  100 
 
 		 779 aa  1580    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1920  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 800 aa  258  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2225  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 812 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.946751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02502  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 809 aa  147  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00256111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0989  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 824 aa  127  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.829693  normal  0.277398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3333  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 858 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 693 aa  88.2  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  22.48 
 
 		 709 aa  87.4  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  24.11 
 
 		 708 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  22.96 
 
 		 699 aa  82.4  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  23.6 
 
 		 703 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1790  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 816 aa  79.7  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0607055 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  23.66 
 
 		 678 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3760  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 802 aa  78.2  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.86 
 
 		 703 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  23.36 
 
 		 692 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 707 aa  77.4  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 821 aa  75.1  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  22.46 
 
 		 723 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  23.11 
 
 		 724 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  21.43 
 
 		 784 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  22.12 
 
 		 708 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 702 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  22.84 
 
 		 724 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 702 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0611  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 773 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000075991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 703 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 850 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.42 
 
 		 833 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  21.36 
 
 		 701 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  21.99 
 
 		 696 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  21.64 
 
 		 720 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 		 803 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 696 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  20.66 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 770 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  21.38 
 
 		 696 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  29.8 
 
 		 815 aa  67.4  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  23.21 
 
 		 808 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  29.95 
 
 		 815 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  20.51 
 
 		 720 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  24.83 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 693 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  20.92 
 
 		 720 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  22.5 
 
 		 749 aa  66.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 693 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3375  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 824 aa  65.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31809  normal  0.581234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 820 aa  65.1  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 823 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 710 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 715 aa  64.7  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5324  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 710 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0890511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  21.99 
 
 		 717 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 806 aa  64.3  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  30.48 
 
 		 814 aa  64.3  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  26.29 
 
 		 789 aa  63.9  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 694 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 795 aa  63.9  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  30.14 
 
 		 828 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3242  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 811 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000414671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  22.34 
 
 		 728 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  21.99 
 
 		 728 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  20.63 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2930  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 810 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  23.65 
 
 		 680 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2785  TonB-dependent siderophore receptor  22.44 
 
 		 786 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00424821  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 821 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 823 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 823 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 820 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  22.07 
 
 		 742 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  22.08 
 
 		 714 aa  61.2  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  26.2 
 
 		 808 aa  61.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  21.88 
 
 		 717 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  22.85 
 
 		 730 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 715 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 820 aa  60.8  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 929 aa  60.8  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  20.52 
 
 		 703 aa  60.8  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  22.7 
 
 		 795 aa  60.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  27.52 
 
 		 716 aa  60.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 739 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 755 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 821 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  27.13 
 
 		 812 aa  60.1  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  23.48 
 
 		 719 aa  60.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  33.91 
 
 		 860 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 713 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 828 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  21.49 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  21.65 
 
 		 730 aa  58.9  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 810 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 		 778 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  21.74 
 
 		 705 aa  58.5  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 744 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>