More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1920 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1920  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 800 aa  1629    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01786  putative TonB dependent receptor  29.19 
 
 		 779 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0396  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 799 aa  206  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2956  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 790 aa  206  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02502  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 809 aa  163  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00256111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2225  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 812 aa  160  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.946751  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3760  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 802 aa  138  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1790  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 816 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0607055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3333  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 858 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0989  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 824 aa  123  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.829693  normal  0.277398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 785 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 		 696 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  22.61 
 
 		 696 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  23.7 
 
 		 692 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  22.76 
 
 		 740 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  22.85 
 
 		 748 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  22.85 
 
 		 748 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  22.44 
 
 		 749 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  21.31 
 
 		 714 aa  75.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.2 
 
 		 708 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.76 
 
 		 711 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  23.46 
 
 		 710 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  22.27 
 
 		 837 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 709 aa  72.8  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  21 
 
 		 767 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  23.24 
 
 		 699 aa  72.4  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  22.52 
 
 		 701 aa  71.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 		 737 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  22.76 
 
 		 789 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 		 727 aa  70.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 776 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  23.11 
 
 		 810 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 705 aa  69.7  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 742 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  22.94 
 
 		 810 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 796 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  24.95 
 
 		 709 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 712 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 696 aa  67.4  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  21.2 
 
 		 742 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  21.2 
 
 		 742 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 		 738 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 708 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 696 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 		 742 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 745 aa  66.6  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  20.28 
 
 		 710 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 705 aa  65.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  21.01 
 
 		 770 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 823 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 823 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  20.85 
 
 		 710 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  22.28 
 
 		 753 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  21.95 
 
 		 701 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 696 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 823 aa  64.7  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 696 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  22.32 
 
 		 703 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 701 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  21.55 
 
 		 765 aa  64.3  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 820 aa  63.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  28.5 
 
 		 696 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 743 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  23.79 
 
 		 859 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  22.78 
 
 		 726 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  24.17 
 
 		 700 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  28.5 
 
 		 696 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  23.45 
 
 		 809 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  28.5 
 
 		 696 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  28.5 
 
 		 698 aa  63.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 702 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 702 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 701 aa  63.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 737 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  22.64 
 
 		 708 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  22.52 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 		 711 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2875  outer membrane protein  28.3 
 
 		 733 aa  62.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.917114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  22.27 
 
 		 710 aa  62  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3375  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 824 aa  62.4  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31809  normal  0.581234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 708 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  22.02 
 
 		 731 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 799 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  25 
 
 		 815 aa  61.2  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  21.95 
 
 		 665 aa  60.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2930  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  24.06 
 
 		 726 aa  60.8  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 777 aa  60.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 713 aa  60.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 711 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 717 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 719 aa  60.1  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  22.09 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2356  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 700 aa  59.7  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.084285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  20.93 
 
 		 680 aa  60.1  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 717 aa  60.1  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 802 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 698 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>