More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1790 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1790  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 816 aa  1657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0607055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3760  TonB-dependent receptor  71.18 
 
 		 802 aa  1160    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0989  TonB-dependent receptor plug  48.06 
 
 		 824 aa  727    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.829693  normal  0.277398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02502  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 809 aa  335  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00256111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2225  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 812 aa  332  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.946751  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1920  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 800 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01786  putative TonB dependent receptor  26.99 
 
 		 779 aa  79.7  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0396  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 799 aa  79  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2956  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 790 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  21.43 
 
 		 755 aa  73.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 713 aa  70.1  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 745 aa  68.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 707 aa  64.7  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 797 aa  64.3  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 717 aa  64.3  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 719 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 717 aa  64.3  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.8 
 
 		 833 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 733 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 817 aa  60.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  22.2 
 
 		 799 aa  59.7  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  24.69 
 
 		 828 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  23.95 
 
 		 745 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 978 aa  58.9  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  21.52 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 692 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  29.1 
 
 		 713 aa  58.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 728 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 810 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 742 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 810 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 708 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  24.87 
 
 		 724 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  25.79 
 
 		 695 aa  56.6  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 724 aa  56.2  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 683 aa  56.6  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 802 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 810 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 701 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  23.02 
 
 		 707 aa  55.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 720 aa  55.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 814 aa  55.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 		 710 aa  55.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  21.36 
 
 		 727 aa  55.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  25.56 
 
 		 726 aa  55.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  24.73 
 
 		 656 aa  55.5  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 810 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  21.58 
 
 		 710 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  26.2 
 
 		 753 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  23.01 
 
 		 824 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00133  FhuE receptor  26.34 
 
 		 697 aa  54.7  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.95 
 
 		 806 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 724 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3333  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 858 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 724 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 737 aa  54.3  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 766 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 738 aa  54.3  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 723 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 820 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  26.39 
 
 		 724 aa  53.9  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 821 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  26.46 
 
 		 689 aa  53.5  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  21.78 
 
 		 740 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 664 aa  53.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 797 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 785 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 823 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.95 
 
 		 797 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 823 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 877 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  22.79 
 
 		 710 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 689 aa  53.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 723 aa  52.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 785 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 769 aa  52.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 863 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  24.21 
 
 		 812 aa  52.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3803  TonB-dependent receptor, plug  27.91 
 
 		 807 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 727 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2356  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 700 aa  52.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.084285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  21.43 
 
 		 710 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 710 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 829 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 693 aa  52  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  26.29 
 
 		 678 aa  52  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3233  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 738 aa  52  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 738 aa  52  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 733 aa  51.6  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  21.43 
 
 		 770 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 808 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  21.86 
 
 		 736 aa  51.6  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  23.05 
 
 		 728 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 797 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 715 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>