More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2690 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  76.83 
 
 		 820 aa  1327    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  74.94 
 
 		 815 aa  1289    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2930  TonB-dependent receptor plug  78.65 
 
 		 810 aa  1355    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  74.39 
 
 		 820 aa  1295    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  74.45 
 
 		 814 aa  1287    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  72.59 
 
 		 821 aa  1262    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  72.47 
 
 		 821 aa  1258    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1445  TonB-dependent receptor, plug  70.7 
 
 		 825 aa  1212    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000476077  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 812 aa  1669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  74.88 
 
 		 820 aa  1302    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3803  TonB-dependent receptor, plug  50.31 
 
 		 807 aa  810    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  74.51 
 
 		 823 aa  1280    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  74.36 
 
 		 823 aa  1275    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2440  TonB-dependent receptor, plug  72.4 
 
 		 825 aa  1263    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000351973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3375  TonB-dependent receptor plug  75.49 
 
 		 824 aa  1293    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31809  normal  0.581234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  74.63 
 
 		 823 aa  1282    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3242  TonB-dependent receptor  79.31 
 
 		 811 aa  1362    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000414671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  24.57 
 
 		 711 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 712 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 740 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 738 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 748 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 748 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 749 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 		 707 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 737 aa  152  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 742 aa  144  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  25.69 
 
 		 742 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 715 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 723 aa  127  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 724 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 724 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 720 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 714 aa  125  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 720 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 720 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 720 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  38.32 
 
 		 713 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  33.04 
 
 		 699 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 		 712 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  36.17 
 
 		 707 aa  111  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  23.21 
 
 		 709 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  23.71 
 
 		 690 aa  108  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  23.54 
 
 		 709 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  23.09 
 
 		 702 aa  108  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 		 742 aa  107  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 		 742 aa  107  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  24.22 
 
 		 697 aa  104  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 770 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  33.78 
 
 		 706 aa  104  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 815 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 757 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 710 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 701 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 701 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 701 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  23.18 
 
 		 701 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 795 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 710 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  38.56 
 
 		 710 aa  101  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 722 aa  101  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 701 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 719 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 701 aa  100  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  35.09 
 
 		 703 aa  99.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 722 aa  99.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 776 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 728 aa  99.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 		 743 aa  98.6  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  36.61 
 
 		 810 aa  99  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 		 702 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 		 702 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 701 aa  98.2  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 694 aa  97.8  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.47 
 
 		 724 aa  97.8  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 701 aa  97.8  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 715 aa  97.4  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  31.09 
 
 		 715 aa  97.4  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  32 
 
 		 689 aa  97.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  33.51 
 
 		 726 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 806 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 		 709 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.77 
 
 		 743 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 814 aa  96.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 720 aa  96.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 679 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 796 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 796 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 921 aa  95.5  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 921 aa  95.5  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 837 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 796 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 881 aa  95.1  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 882 aa  95.1  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 881 aa  94.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 881 aa  94.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  37.16 
 
 		 708 aa  94.4  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 796 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 		 709 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  38.73 
 
 		 757 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>