More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3803 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  48.53 
 
 		 820 aa  781    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  50.73 
 
 		 815 aa  803    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3242  TonB-dependent receptor  50.12 
 
 		 811 aa  796    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000414671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  48.72 
 
 		 821 aa  770    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  49.88 
 
 		 820 aa  784    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3375  TonB-dependent receptor plug  51.28 
 
 		 824 aa  778    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31809  normal  0.581234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1445  TonB-dependent receptor, plug  49.76 
 
 		 825 aa  792    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000476077  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  49.76 
 
 		 820 aa  783    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3803  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 807 aa  1652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  49.69 
 
 		 823 aa  785    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  49.57 
 
 		 823 aa  781    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  49.39 
 
 		 814 aa  783    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2440  TonB-dependent receptor, plug  51.52 
 
 		 825 aa  821    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000351973  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  48.72 
 
 		 821 aa  770    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  50.31 
 
 		 812 aa  810    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2930  TonB-dependent receptor plug  51.4 
 
 		 810 aa  797    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  49.94 
 
 		 823 aa  790    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 740 aa  157  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  24.94 
 
 		 742 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 749 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 742 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 		 738 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 748 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 748 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  23.27 
 
 		 737 aa  146  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.79 
 
 		 724 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 724 aa  145  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 711 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 723 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 715 aa  135  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  22.67 
 
 		 720 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  22.26 
 
 		 720 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  23.55 
 
 		 716 aa  123  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.84 
 
 		 724 aa  124  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 720 aa  120  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 		 825 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  35.86 
 
 		 815 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  22.94 
 
 		 701 aa  111  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  22.61 
 
 		 702 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  22.61 
 
 		 702 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 712 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 707 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 720 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.54 
 
 		 713 aa  104  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  22.47 
 
 		 713 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 720 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  22.8 
 
 		 691 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 701 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 721 aa  99  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  33.08 
 
 		 701 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  33.08 
 
 		 701 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 762 aa  98.6  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 722 aa  98.2  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  21.52 
 
 		 701 aa  98.2  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  33.82 
 
 		 689 aa  97.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 714 aa  96.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 		 712 aa  97.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  33.52 
 
 		 837 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 701 aa  96.3  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 701 aa  95.9  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  24.83 
 
 		 722 aa  95.5  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 723 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 708 aa  94.4  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 712 aa  94  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 707 aa  94  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 		 719 aa  92.8  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01148  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.02 
 
 		 708 aa  93.2  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 		 701 aa  91.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 706 aa  90.9  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  26.69 
 
 		 699 aa  90.9  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  32.48 
 
 		 713 aa  90.9  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  21.95 
 
 		 730 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  29.5 
 
 		 850 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 810 aa  90.5  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 689 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 728 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0974  TonB-dependent siderophore receptor  30.81 
 
 		 737 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.930305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 		 715 aa  89.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  22.45 
 
 		 693 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 742 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  34.5 
 
 		 809 aa  89  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 696 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  31.28 
 
 		 814 aa  89  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  29.95 
 
 		 718 aa  88.6  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 701 aa  89  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 		 719 aa  89  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  22.52 
 
 		 693 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 713 aa  88.6  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.4 
 
 		 696 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  38.24 
 
 		 757 aa  88.2  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  28.37 
 
 		 715 aa  88.2  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  30.69 
 
 		 710 aa  88.2  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 757 aa  88.2  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  38.24 
 
 		 709 aa  87.8  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 		 706 aa  87.8  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  34.07 
 
 		 706 aa  87.4  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  20.61 
 
 		 799 aa  87.8  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 725 aa  87.4  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 796 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 796 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>