More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01148 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2461  TonB-dependent siderophore receptor  70.18 
 
 		 713 aa  1022    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01148  TonB-dependent outer membrane Receptor  100 
 
 		 708 aa  1439    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1527  TonB-dependent siderophore receptor  44.53 
 
 		 714 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.698269  normal  0.163231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  43.95 
 
 		 742 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  43.89 
 
 		 742 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  43.79 
 
 		 738 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  42.82 
 
 		 712 aa  534  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  42.72 
 
 		 748 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  41.6 
 
 		 737 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  42.72 
 
 		 748 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  42.86 
 
 		 749 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  42.3 
 
 		 740 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  40.73 
 
 		 711 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 824 aa  233  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 815 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.16 
 
 		 708 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 779 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 814 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 711 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  31.59 
 
 		 689 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 712 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 837 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.11 
 
 		 709 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 708 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 850 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 817 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 789 aa  205  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.81 
 
 		 711 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 770 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 710 aa  203  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 710 aa  203  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 722 aa  202  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 766 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 710 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 710 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.26 
 
 		 706 aa  201  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 825 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 		 707 aa  198  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 706 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 706 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 		 741 aa  196  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 820 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 860 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 794 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 730 aa  193  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.2 
 
 		 792 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 701 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 699 aa  192  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 705 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.77 
 
 		 713 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 828 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 744 aa  188  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 721 aa  188  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.45 
 
 		 724 aa  187  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 797 aa  187  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  27.38 
 
 		 799 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 802 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  26.92 
 
 		 791 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 828 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  26.33 
 
 		 821 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 791 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 828 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 744 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 859 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  26.39 
 
 		 729 aa  184  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 843 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 726 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 702 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.77 
 
 		 806 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 702 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 817 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 722 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 707 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 714 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 720 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 757 aa  180  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 722 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 745 aa  180  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 829 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 701 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 715 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.8 
 
 		 708 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 701 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 701 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.29 
 
 		 703 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 701 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 720 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  27.08 
 
 		 695 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 710 aa  177  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  26.64 
 
 		 810 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 822 aa  177  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 715 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 810 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 720 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 712 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 709 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 710 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 721 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>