More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2768 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  74.88 
 
 		 820 aa  1286    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  92.59 
 
 		 815 aa  1566    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  84.35 
 
 		 821 aa  1443    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2930  TonB-dependent receptor plug  79.26 
 
 		 810 aa  1349    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  86.74 
 
 		 820 aa  1486    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1445  TonB-dependent receptor, plug  71.46 
 
 		 825 aa  1217    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000476077  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3803  TonB-dependent receptor, plug  49.69 
 
 		 807 aa  785    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 823 aa  1686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3375  TonB-dependent receptor plug  76.14 
 
 		 824 aa  1292    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31809  normal  0.581234 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  99.15 
 
 		 823 aa  1667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  83.99 
 
 		 821 aa  1446    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  84.96 
 
 		 814 aa  1444    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2440  TonB-dependent receptor, plug  73.77 
 
 		 825 aa  1259    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000351973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  87.35 
 
 		 820 aa  1491    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3242  TonB-dependent receptor  77.6 
 
 		 811 aa  1331    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000414671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  74.51 
 
 		 812 aa  1280    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  98.78 
 
 		 823 aa  1667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  25.09 
 
 		 712 aa  160  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  23.28 
 
 		 707 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 715 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 724 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 		 724 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 713 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  32.27 
 
 		 712 aa  127  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  31.66 
 
 		 723 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 720 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 720 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 720 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 		 702 aa  124  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  32.16 
 
 		 702 aa  124  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 720 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 714 aa  121  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.05 
 
 		 713 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  36.25 
 
 		 738 aa  119  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  34.35 
 
 		 742 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 		 742 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  34.82 
 
 		 737 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 722 aa  116  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  29.59 
 
 		 715 aa  115  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 		 740 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 		 748 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 		 749 aa  115  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  35.78 
 
 		 748 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  33.79 
 
 		 699 aa  114  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 719 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 722 aa  112  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 		 757 aa  111  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 		 770 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  31.17 
 
 		 708 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 710 aa  108  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  30.74 
 
 		 689 aa  108  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  22.11 
 
 		 767 aa  107  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 		 881 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 		 921 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  34.71 
 
 		 707 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 881 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 		 921 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 881 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 		 882 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 701 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  36.92 
 
 		 679 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 713 aa  105  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  35.05 
 
 		 810 aa  104  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 		 701 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  33.86 
 
 		 719 aa  102  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  34.23 
 
 		 710 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  37.44 
 
 		 742 aa  101  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  33.16 
 
 		 701 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  33.16 
 
 		 701 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  34.48 
 
 		 705 aa  101  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  36.6 
 
 		 710 aa  101  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  33.2 
 
 		 696 aa  100  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  36.13 
 
 		 858 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  32.04 
 
 		 701 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  30.42 
 
 		 716 aa  100  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  22.99 
 
 		 753 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  30.58 
 
 		 703 aa  99.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6108  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 796 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 706 aa  99.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 		 743 aa  99  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.19 
 
 		 706 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.61 
 
 		 806 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 701 aa  99  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 815 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  28.52 
 
 		 710 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 796 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 		 711 aa  98.6  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 837 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 		 701 aa  98.2  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  30.37 
 
 		 701 aa  98.2  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.76 
 
 		 797 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 762 aa  97.8  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 720 aa  97.8  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 		 863 aa  97.4  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  29.31 
 
 		 776 aa  97.8  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 795 aa  97.4  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  34.24 
 
 		 796 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  32.41 
 
 		 796 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 806 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  35.6 
 
 		 855 aa  97.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>