More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3760 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1790  TonB-dependent receptor  71.18 
 
 		 816 aa  1160    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0607055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0989  TonB-dependent receptor plug  50 
 
 		 824 aa  734    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.829693  normal  0.277398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3760  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 802 aa  1614    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2225  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 812 aa  348  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.946751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02502  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 809 aa  348  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00256111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1920  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 800 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 713 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  22.72 
 
 		 696 aa  92.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0396  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 799 aa  91.3  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2956  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 790 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01786  putative TonB dependent receptor  25.52 
 
 		 779 aa  78.2  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  26.8 
 
 		 745 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  22.94 
 
 		 747 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  25.16 
 
 		 817 aa  65.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3333  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 858 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 752 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 741 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 736 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 736 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  23 
 
 		 801 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 710 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 787 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  26.17 
 
 		 729 aa  61.6  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  24.62 
 
 		 753 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  24.62 
 
 		 753 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 737 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 738 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3640  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 767 aa  60.1  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0918046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 745 aa  58.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  26.79 
 
 		 680 aa  57.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00133  FhuE receptor  25.94 
 
 		 697 aa  57.4  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 717 aa  57  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  26.41 
 
 		 707 aa  57  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 727 aa  57  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 829 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 822 aa  57  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 799 aa  57.4  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 717 aa  56.6  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 719 aa  56.6  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 734 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  21.14 
 
 		 683 aa  56.2  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 702 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 702 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 723 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 828 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1821  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 712 aa  55.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 742 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 821 aa  55.1  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  21.47 
 
 		 710 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 738 aa  55.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  27.81 
 
 		 733 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.52 
 
 		 833 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 728 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 797 aa  53.9  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1347  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 820 aa  53.9  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475888  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 698 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 692 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  21.47 
 
 		 742 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 690 aa  53.9  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 785 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  28.78 
 
 		 815 aa  53.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  23.4 
 
 		 740 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 799 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 727 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 723 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2539  TonB-dependent siderophore receptor  20.63 
 
 		 719 aa  52.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 		 840 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 766 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.35 
 
 		 689 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 741 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 823 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 742 aa  53.5  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  24.6 
 
 		 729 aa  52.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3242  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 811 aa  52.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000414671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 729 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  24.37 
 
 		 812 aa  52.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 737 aa  52.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  22.14 
 
 		 740 aa  52.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  24.73 
 
 		 722 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 708 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  21.17 
 
 		 748 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 698 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 746 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 823 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  21.17 
 
 		 748 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 775 aa  51.6  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 699 aa  52  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 713 aa  51.6  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  23.02 
 
 		 656 aa  51.2  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 819 aa  51.2  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 785 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  27.93 
 
 		 753 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3803  TonB-dependent receptor, plug  29.32 
 
 		 807 aa  51.2  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 		 797 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 711 aa  50.8  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 		 696 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 750 aa  50.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  27.34 
 
 		 814 aa  50.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1445  TonB-dependent receptor, plug  25.15 
 
 		 825 aa  50.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000476077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>