More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1821 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1821  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 712 aa  1433    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 736 aa  193  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 826 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 722 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 803 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  29.52 
 
 		 695 aa  181  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  26.81 
 
 		 810 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 730 aa  180  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 703 aa  180  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.87 
 
 		 703 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 746 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 827 aa  178  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 703 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 		 701 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 722 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.33 
 
 		 743 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 822 aa  177  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 723 aa  177  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 723 aa  177  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 860 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 731 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 722 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 816 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 815 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 709 aa  173  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 		 814 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 821 aa  173  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 729 aa  173  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  26.45 
 
 		 720 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 733 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 733 aa  172  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 706 aa  171  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 706 aa  171  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  26.2 
 
 		 713 aa  170  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 817 aa  170  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 820 aa  170  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 696 aa  169  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  27.6 
 
 		 802 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 794 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 824 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 724 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 		 722 aa  167  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 701 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  26.92 
 
 		 716 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 799 aa  164  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 725 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  27.95 
 
 		 729 aa  163  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 833 aa  163  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 757 aa  163  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 724 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 747 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 744 aa  161  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  27.48 
 
 		 696 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  25.79 
 
 		 841 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 840 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 829 aa  161  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  27.48 
 
 		 696 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  27.48 
 
 		 696 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 744 aa  160  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 725 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  27.26 
 
 		 729 aa  160  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  26.69 
 
 		 752 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 750 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 722 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 724 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 830 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  27.26 
 
 		 696 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  28.24 
 
 		 815 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  27.54 
 
 		 698 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  27.45 
 
 		 729 aa  158  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 724 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  27.35 
 
 		 808 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  25.52 
 
 		 799 aa  157  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 711 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  27.16 
 
 		 747 aa  156  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.28 
 
 		 708 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  26.06 
 
 		 812 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 787 aa  156  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  26.84 
 
 		 752 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  26.65 
 
 		 745 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  27.31 
 
 		 729 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  27.03 
 
 		 747 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 696 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.86 
 
 		 833 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2539  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 719 aa  154  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.44 
 
 		 696 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  27.03 
 
 		 747 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 726 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 800 aa  154  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  26.14 
 
 		 693 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  26.63 
 
 		 703 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  25.57 
 
 		 799 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  26.63 
 
 		 703 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 699 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.66 
 
 		 703 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 705 aa  152  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  27.03 
 
 		 729 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.82 
 
 		 801 aa  151  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 821 aa  151  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 817 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>