More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1286 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  43.22 
 
 		 980 aa  715    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 978 aa  2010    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 708 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 843 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 715 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.44 
 
 		 708 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 710 aa  134  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.12 
 
 		 709 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 		 850 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  34.8 
 
 		 711 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 708 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 862 aa  130  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1146 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 741 aa  128  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.4 
 
 		 703 aa  128  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.63 
 
 		 711 aa  127  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 825 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 825 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  37.79 
 
 		 859 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 1245 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 		 710 aa  125  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 730 aa  124  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 864 aa  124  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.76 
 
 		 817 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 		 722 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.2 
 
 		 703 aa  121  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 703 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  32.22 
 
 		 701 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 929 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.92 
 
 		 815 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 1247 aa  118  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 860 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1302 aa  116  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 715 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 701 aa  114  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1245 aa  114  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 692 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 817 aa  114  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  35.68 
 
 		 1243 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 		 694 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1202 aa  111  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  24.41 
 
 		 814 aa  111  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.56 
 
 		 833 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 709 aa  111  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 719 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 743 aa  110  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.18 
 
 		 696 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1273 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0338  ferrioxamine B receptor precursor protein  26.28 
 
 		 705 aa  108  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 837 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 696 aa  108  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 736 aa  108  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  27.63 
 
 		 799 aa  108  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 		 689 aa  108  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 717 aa  107  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 717 aa  107  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 797 aa  106  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 732 aa  106  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  29.2 
 
 		 714 aa  106  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 799 aa  106  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  35.68 
 
 		 1289 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 727 aa  106  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  28.01 
 
 		 724 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3331  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 		 766 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 794 aa  105  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1243 aa  105  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 734 aa  104  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 715 aa  104  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  22.61 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 967 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 728 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 728 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  28.14 
 
 		 808 aa  104  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 723 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 726 aa  103  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 738 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  27.82 
 
 		 729 aa  102  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 769 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  25.67 
 
 		 726 aa  102  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 810 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  39.88 
 
 		 1232 aa  102  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  28.17 
 
 		 747 aa  102  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 706 aa  102  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 724 aa  102  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 518 aa  101  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  26.76 
 
 		 747 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 810 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 707 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 721 aa  100  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  26.76 
 
 		 745 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 745 aa  100  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 		 810 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 755 aa  99.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 812 aa  99.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 771 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 829 aa  100  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 810 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  27.49 
 
 		 678 aa  100  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  26.41 
 
 		 729 aa  99.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 819 aa  99.8  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>