More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1125 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 967 aa  1967    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 929 aa  128  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 978 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  32.74 
 
 		 727 aa  99  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1302 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1232 aa  89  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 720 aa  89  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1245 aa  89  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1273 aa  88.6  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.63 
 
 		 703 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  28.39 
 
 		 755 aa  87.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1146 aa  85.9  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 701 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 		 702 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 		 702 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1247 aa  83.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  30.12 
 
 		 703 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1202 aa  82.8  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  30.12 
 
 		 708 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1314 aa  81.6  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 708 aa  81.6  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1134 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 712 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1243 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 710 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 692 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 980 aa  79  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1245 aa  78.2  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 703 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 747 aa  78.2  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 708 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.14 
 
 		 709 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1153 aa  77.4  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 817 aa  75.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.6 
 
 		 711 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 710 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1289 aa  75.5  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.68 
 
 		 711 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1294 aa  75.1  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 896 aa  75.1  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 767 aa  75.1  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1091 aa  74.3  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  29.85 
 
 		 695 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 693 aa  74.3  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 829 aa  74.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 735 aa  74.3  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 710 aa  73.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 769 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 748 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 722 aa  73.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 748 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 740 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 751 aa  72.4  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1243 aa  72.4  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 749 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  28.08 
 
 		 729 aa  72  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  30.35 
 
 		 727 aa  71.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 720 aa  71.2  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2690  TonB-dependent receptor, plug  29.17 
 
 		 812 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.74 
 
 		 696 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1297 aa  70.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 		 784 aa  70.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1221 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 722 aa  70.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 860 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 717 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 771 aa  69.3  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 717 aa  69.7  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.64 
 
 		 833 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 709 aa  68.9  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 696 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3064  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 712 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 806 aa  68.2  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  33.16 
 
 		 778 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 723 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 704 aa  67  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  28 
 
 		 699 aa  67.4  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 737 aa  67.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 707 aa  67  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 877 aa  67  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 724 aa  67  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 724 aa  66.6  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 715 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.18 
 
 		 724 aa  67  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  25.35 
 
 		 694 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 719 aa  66.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 718 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 724 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  25.47 
 
 		 724 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 769 aa  66.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 		 717 aa  65.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 843 aa  65.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.42 
 
 		 713 aa  65.5  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1144 aa  65.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 726 aa  65.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  29.17 
 
 		 801 aa  65.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  27.63 
 
 		 740 aa  65.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 722 aa  65.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 734 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 715 aa  65.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>