More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0596 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1245 aa  2538    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  36.19 
 
 		 1314 aa  678    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  79.8 
 
 		 1243 aa  2012    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  52.05 
 
 		 1294 aa  1244    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  52.38 
 
 		 1297 aa  1226    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  40.16 
 
 		 1221 aa  785    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  43.41 
 
 		 1273 aa  882    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  37.06 
 
 		 1247 aa  665    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 1202 aa  605  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 1302 aa  583  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 1289 aa  580  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1146 aa  548  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1245 aa  460  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1243 aa  439  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1134 aa  241  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1144 aa  229  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 1146 aa  202  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 929 aa  164  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1232 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1153 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1149 aa  143  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 		 1091 aa  136  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 978 aa  114  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 980 aa  106  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.53 
 
 		 722 aa  87.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 732 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 755 aa  83.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 727 aa  81.6  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  26.2 
 
 		 703 aa  81.6  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 722 aa  80.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 732 aa  79.7  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 757 aa  77.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 701 aa  75.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3560  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 710 aa  75.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 701 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 701 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1808  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 739 aa  75.5  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 710 aa  74.7  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 757 aa  74.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 694 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  25.91 
 
 		 689 aa  73.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.35 
 
 		 833 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 708 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 967 aa  74.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 715 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 701 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  25.77 
 
 		 701 aa  73.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 829 aa  72.4  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 862 aa  72  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3047  TonB-dependent siderophore receptor  27.2 
 
 		 737 aa  72  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 817 aa  71.6  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 701 aa  70.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 723 aa  69.7  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 699 aa  69.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 896 aa  69.3  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 753 aa  69.3  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 832 aa  69.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 859 aa  68.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 683 aa  68.6  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 797 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 736 aa  68.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 797 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.02 
 
 		 708 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 797 aa  68.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  24.85 
 
 		 738 aa  67.8  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 708 aa  68.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  29.17 
 
 		 709 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.22 
 
 		 711 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.41 
 
 		 703 aa  67  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  22 
 
 		 692 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 776 aa  67.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 701 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 748 aa  66.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 748 aa  66.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  26.05 
 
 		 518 aa  66.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 701 aa  66.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 793 aa  66.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2558  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 760 aa  66.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.897783  normal  0.0361628 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  26.17 
 
 		 728 aa  65.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.18 
 
 		 707 aa  65.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 737 aa  65.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 740 aa  65.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  21.8 
 
 		 806 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 711 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.05 
 
 		 703 aa  65.1  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 736 aa  65.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 733 aa  65.1  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 766 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 784 aa  64.3  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 735 aa  64.3  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.36 
 
 		 713 aa  64.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 732 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 726 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 710 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 851 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 714 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 708 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 749 aa  63.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 734 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>