More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4287 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4280  TonB-dependent receptor plug  47.91 
 
 		 1144 aa  1049    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4287  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1149 aa  2362    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4279  TonB-dependent receptor plug  44.24 
 
 		 1153 aa  932    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4278  TonB-dependent receptor plug  49.91 
 
 		 1146 aa  1058    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4266  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1091 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1349  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1232 aa  274  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 1146 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3234  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1221 aa  223  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763048  normal  0.0174911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2317  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 1202 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2495  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1247 aa  165  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1013  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1273 aa  162  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0530732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0596  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1245 aa  153  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1243 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1314 aa  145  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2928  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1245 aa  145  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1794  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1302 aa  144  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3199  TonB-dependent receptor plug  33.22 
 
 		 1297 aa  141  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0600  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1294 aa  141  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2901  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1134 aa  135  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 929 aa  125  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1755  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1289 aa  125  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1754  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1243 aa  107  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1286  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 978 aa  90.9  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1267  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 980 aa  86.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  28.36 
 
 		 718 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0522  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 817 aa  68.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0514  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 768 aa  68.2  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400369  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3723  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 767 aa  66.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 896 aa  65.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0530  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 767 aa  65.5  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.898854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 723 aa  64.7  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 701 aa  64.3  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 726 aa  63.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  24.56 
 
 		 735 aa  63.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  27.37 
 
 		 719 aa  62.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 714 aa  63.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 714 aa  63.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 802 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2131  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 757 aa  61.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0772564  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 721 aa  60.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  25.16 
 
 		 699 aa  60.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3330  hypothetical protein  26.84 
 
 		 714 aa  60.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.641382  normal  0.572781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  28.5 
 
 		 728 aa  60.1  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2275  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 779 aa  60.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00175316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  23.96 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.91 
 
 		 797 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 701 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 699 aa  59.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.1 
 
 		 806 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 821 aa  59.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  25.58 
 
 		 740 aa  58.9  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 722 aa  58.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1352  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 832 aa  58.9  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  23.87 
 
 		 745 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.14 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 708 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  25.46 
 
 		 710 aa  58.5  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 755 aa  58.2  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.6 
 
 		 709 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 793 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 837 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 736 aa  57.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 720 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 732 aa  57  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 708 aa  56.6  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 729 aa  57  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  24.91 
 
 		 728 aa  57.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 		 822 aa  57  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 732 aa  57  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0947  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 683 aa  57  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0779656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 734 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.86 
 
 		 801 aa  56.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 727 aa  56.2  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03559  putative outer membrane receptor for iron transport  27.88 
 
 		 761 aa  55.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143456  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 715 aa  55.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 694 aa  55.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 725 aa  55.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  25.12 
 
 		 703 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2724  FhuE receptor  27.96 
 
 		 707 aa  55.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 719 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.12 
 
 		 708 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 840 aa  55.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 692 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  26.11 
 
 		 815 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 745 aa  55.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  26.32 
 
 		 743 aa  55.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 740 aa  55.1  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 806 aa  55.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1125  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 967 aa  54.3  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  23.63 
 
 		 819 aa  54.3  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 862 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 850 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 724 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 722 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 793 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>